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R包SCENIC:結(jié)果可視化與分析
1.鑒定細(xì)胞狀態(tài) 以t-SNE圖呈現(xiàn)AUC評(píng)分和TF表達(dá)情況（即調(diào)控元件的活動(dòng)度） 利用AUC 交互app（Scope） logMat <- e...
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R包SCENIC：分析流程
GRN：基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò) 分為四步進(jìn)行GRN分析 1.GENIE3/GRNBoost：基于共表達(dá)情況鑒定每個(gè)TF的潛在靶點(diǎn); 過濾表達(dá)矩陣并運(yùn)行R包...
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R包SCENIC:input數(shù)據(jù)準(zhǔn)備
sample dataset：下載Single-cell analysis of mouse cortex或者GEO數(shù)據(jù)庫下載GSE60361數(shù)...
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R包SCENIC:安裝
SCENIC:Single Cell rEgulatory Network Inference and Clustering 目前支持分析的物種...
