Conda是一個(gè)非常好用的工具，既可以管理packages，也可以管理和下載軟件，還可以建立多個(gè)虛擬環(huán)境來獨(dú)立運(yùn)行多個(gè)版本的軟件。conda分為anaconda和miniconda。anaconda是包含一些常用包,miniconda是精簡版。做生信常常用的一些包只支持老版本的R，一些新開發(fā)的包又只支持最新的R，這里我們用conda建立多個(gè)版本的R環(huán)境。 conda的安裝： 下載地址：https://www.anaconda.com/distribution/ https://docs.anaconda.com/anaconda/install/
查看是否安裝conda，從終端輸入
conda --version
#或者
which conda
如果安裝了的話，會(huì)顯示現(xiàn)在所用的版本等信息，沒有的話，可以下載安裝，安裝好了別忘記配置環(huán)境變量。
# 以anaconda3為例：
echo 'export PATH="~/anaconda3/bin:$PATH"' >> ~/.bashrc
source ~/.bashrc
環(huán)境創(chuàng)建：conda create -n new_env(環(huán)境名）
環(huán)境的查看：
conda env list
如需要安裝特定版本的軟件:
conda install 軟件名=版本號(hào)
最新Python的安裝：
conda create -n py37 python=3.7
#或者
conda create --name python37 python=3.7
進(jìn)入python 3.7 環(huán)境：
conda activate py37
#或者
source activate py37
退出環(huán)境：
conda deactivate
#或者
source deactivate py37
創(chuàng)建不同版本R環(huán)境：
conda create -n r36 r=3.6
安裝特定版本R
conda install -c r r=3.6
#或
conda install r=3.6
conda來安裝R的packages https://docs.anaconda.com/anaconda/packages/r-language-pkg-docs/
conda install -c r r-dplyr
查看已創(chuàng)建的環(huán)境：
conda info --envs
#或者
conda env list
最后不需要的環(huán)境需要移除的話：
conda remove -n py27 --all
復(fù)制一個(gè)環(huán)境：
image.png
