因?yàn)樽罱吹揭粋€(gè)斑馬魚單細(xì)胞的文獻(xiàn),看實(shí)驗(yàn)部分的時(shí)候,看那斑馬魚品種看得我很懵逼,就索性了解下下咯
TgBAC(agrp2:Gal4-VP16)tlv05; Tg(UAS:nfsB-mCherry)c264; Tg(foxd3:EGFP)zf104
Tg(tph2:mCherry)y227; Tg(gfap:EGFP)mi2001
剛開始的時(shí)候Tg我也不懂
后來百度了下
剛好看到有一個(gè)文獻(xiàn)是講這方面內(nèi)容
文獻(xiàn)名字是《斑馬魚突變體和轉(zhuǎn)基因魚系命名規(guī)則簡介》

文獻(xiàn)是Agouti-Related Protein 2 Is a New Player in the Teleost Stress Response System
1.命名原則
Tg-Trangene 轉(zhuǎn)基因,
TgBAC/TgPAC表示用BAC或者PAC制備的轉(zhuǎn)基因
轉(zhuǎn)基因載體整合到斑馬魚基因組中造成的
轉(zhuǎn)基因載體的標(biāo)準(zhǔn)表達(dá)式: Tg(promotor:gene)
Tg表示普通轉(zhuǎn)基因,括號內(nèi)則記錄了該載體的最關(guān)鍵特征成分,包括調(diào)控元件(例如: 啟動(dòng)子)以及有編碼功能的基因,兩者用冒號隔開
連續(xù)的調(diào)控元件或者融合讀碼框之間用橫線連接
受同一調(diào)控元件控制的獨(dú)立讀碼框之間用逗號隔開
不同讀碼框受不同調(diào)控元件驅(qū)動(dòng),則采用多組"調(diào)控元件: 編碼序列"的形式依次描述,用逗號分隔
作者給了個(gè)例子


2.閱讀的文獻(xiàn)里的轉(zhuǎn)基因斑馬魚
TgBAC(agrp2:Gal4-VP16)tlv05; Tg(UAS:nfsB-mCherry)c264; Tg(foxd3:EGFP)zf104
作為一個(gè)小白,還去查了mCherry和EGFP是啥,真就這幾個(gè)字母看了半天啊
Tg-Trangene縮寫 表示轉(zhuǎn)基因, TgBAC/TgPAC表示用BAC或者PAC制備的轉(zhuǎn)基因載體
agrp2:Gal4-VP16 agrp2 轉(zhuǎn)錄本表達(dá)的啟動(dòng)子調(diào)控元件, Gal4-VP16 基因的讀碼框,tlv05表示該機(jī)構(gòu)的魚系標(biāo)識。
Tg(foxd3:EGFP)zf104 foxd3轉(zhuǎn)錄本表達(dá)的啟動(dòng)子調(diào)控元件,EGFP基因的讀碼框
TgBAC(agrp2:Gal4-VP16)tlv05; Tg(UAS:nfsB-mCherry)c264;---為了拿到表達(dá)mCherry的Agrp2 pineal cells
Tg(foxd3:EGFP)zf104--為了拿到逼到EGFP 的 pineal neuron cells
Tg(tph2:mCherry)y227---為了拿到mCherry表達(dá)的pineal photoreceptors cells
Tg(gfap:EGFP)mi2001--為了拿到EGFP表達(dá)的astrocyte 和pineal interstitial cells 松果體間充質(zhì)細(xì)胞
補(bǔ)充在后面
mCherry是一種被廣泛用于生物技術(shù)作為示蹤劑的紅色熒光染料,包括分子的標(biāo)記和細(xì)胞組分的定位等。不同于其它從維多利亞水母中分離的GFP蛋白和其它綠色熒光蛋白變體,mCherry以及其它大多數(shù)紅色熒光蛋白是從珊瑚(Discosoma)中分離出來的蛋白。mCherry因?yàn)槠漕伾蛦误w分子的光穩(wěn)定性,比其它熒光蛋白標(biāo)簽更優(yōu)異,其最大激發(fā)光和發(fā)射光分別為587nm和610nm。
EGFP,即增強(qiáng)綠色熒光蛋白(Enhanced Green Fluorescent Protein),GFP,即綠色熒光蛋白(Green fluorescent protein)。EGFP是GFP突變系,應(yīng)用較多的是GFP的突變體:增強(qiáng)型綠色熒光蛋白(EGFP )(64位苯丙一亮),發(fā)射出的熒光強(qiáng)度比GFP大6倍以上。 綠色熒光蛋白,是一個(gè)由約238個(gè)氨基酸組成的蛋白質(zhì),從藍(lán)光到紫外線都能使其激發(fā),發(fā)出綠色熒光。雖然許多其他海洋生物也有類似的綠色熒光蛋白,但傳統(tǒng)上,綠色熒光蛋白(GFP)指首先從維多利亞多管發(fā)光水母中分離的蛋白質(zhì)。