SFS的基本理解、介紹的一篇文章:https://theg-cat.com/tag/joint-sfs/[https://theg-cat.com/tag/joint-sfs...
您好,請問這個地方您是如何使其名稱對應上的:最終找到原因:.bed文件和.cds文件前綴要一樣,ortholog命令會從.cds文件中找.bed文件里的序列名,所以兩個文件的序列名字要一樣,要不然就會報錯。
jcvi畫兩物種的共線性圖參考:https://github.com/tanghaibao/jcvi/wiki/MCscan-(Python-version)[https://github.com/t...
參考:https://github.com/tanghaibao/jcvi/wiki/MCscan-(Python-version)[https://github.com/t...
一、數(shù)據(jù)準備 首先,選取不同物種的Protein數(shù)據(jù)集:Arabidopsis_thaliana.fa;Citrus_grandis.fa;Dimocarpus_longan...
環(huán)境準備 安裝軟件: 參考「基因組學」使用OrthoFinder進行直系同源基因分析 安裝OrthoFinder,然后再安裝CAFE 數(shù)據(jù)準備: 一共會分析mouse, r...
前言:因為最近陸陸續(xù)續(xù)接手了幾個物種的基因組項目,這也是生信分析中很大的一塊。其中最基礎的是組裝和注釋(當然我們實驗室也做組裝方法學的研究)?,F(xiàn)在隨著很多物種基因組的發(fā)表,純...