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PCA計(jì)算原理（超簡單，R代碼）今天介紹如下三點(diǎn)內(nèi)容: PCA是如何計(jì)算的 如何計(jì)算每個PC所能解釋的方差 特征值與PC解釋方差比例的關(guān)系 1. 使用R語言自帶函數(shù)prcomp...
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利用python將pdf圖片批量轉(zhuǎn)換成png
使用該腳本前需要先安裝PyMuPDF庫： 腳本代碼如下： 運(yùn)行該腳本可直接將當(dāng)前目錄下的pdf圖片全部轉(zhuǎn)換成png（pdf圖片仍保留）。 效果如...
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python 之 data.frame
data.frame 實(shí)用方法 pd.read_csv 讀入文件作為data.frame?header:指定是否有標(biāo)題，None無標(biāo)題?sep:...
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GWAS基石---混合線性模型??使用混合線性模型（linear mixed model)做GWAS可以有效校正群體結(jié)構(gòu)和群體內(nèi)復(fù)雜的親緣關(guān)系。因此，目前絕大多數(shù)的GWAS都...
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R語言數(shù)據(jù)科學(xué)第五章：數(shù)據(jù)操作dplyr(上)
超級好用的dplyr， 讓你從數(shù)據(jù)小白跨出一大步。 以下內(nèi)容主要來自 R for data science 書第五章內(nèi)容前半部分，主要講幾個基本...
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使用GEMMA進(jìn)行復(fù)雜性狀全基因組關(guān)聯(lián)分析(GWAS)GEMMA（Genome-wide Efficient Mixed Model Association algorithm）是一款基于混合線性模...
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R markdown制作自動分析報告如果你主要實(shí)用R語言作為分析工具，R markdown可以幫你自動生成分析報告。只要求會一點(diǎn)點(diǎn)markdown語法即可生成html、word、p...
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GCTA計(jì)算親緣關(guān)系矩陣（兩種不同方法）親緣關(guān)系矩陣 親緣關(guān)系矩陣被廣泛用于全基因組關(guān)聯(lián)分析（GWAS）和全基因組選擇（GS）中，當(dāng)然主要是混合線性模型。在GWAS中親緣關(guān)系矩...