1.利用箱線圖比較兩類樣本的某個(gè)細(xì)胞比例差異 比較直觀，但是缺點(diǎn)在于如果單細(xì)胞樣本個(gè)數(shù)過少且異質(zhì)性大，導(dǎo)致很難有統(tǒng)計(jì)學(xué)顯著意義 2.R o/e 比值 好多文章都有用這個(gè)，我的...
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單細(xì)胞細(xì)胞比例分析方法列舉 -
沒有什么不是認(rèn)真搞不定的！?。?/div>
monocle 2擬時(shí)序分析monocle做擬時(shí)序分析首先要構(gòu)建CDS需要3個(gè)矩陣：expr.matrix、pd、fd，其次將Seurat中的對象轉(zhuǎn)換為monocle識別的對象。然后選擇想要做擬時(shí)序依據(jù)...
個(gè)人博客: xuzhougeng.top (隨緣訪問)MSKCC Research Associate<br>別趕不上野心，又辜負(fù)了努力周運(yùn)來，男，長大了才會遇到的帥哥，穩(wěn)健，瀟灑，大方，靠譜。一段生信緣，一棵技能樹。生信技能樹核心成員，單細(xì)胞天地供稿人，簡書創(chuàng)作者，單細(xì)胞數(shù)據(jù)科學(xué)家。利用BiocManager安裝R包1.首先安裝BiocManager包如果你的R版本為3.6版本，請將版本號設(shè)置為version = "3.11"version = "3.12"適用于R 4.0.0 2.通過...
公眾號 R語言數(shù)據(jù)分析指南，歡迎大家關(guān)注
單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組|Seurat 4.0 使用指南后臺有讀者翻到了一年前發(fā)的文獻(xiàn)解讀，請教了一下文章的圖的做法。正好前段時(shí)間剛做過單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組分析，今天就給大家介紹一下常用工具Seurat的用法。 Seurat 4.0 使用...
