1.利用箱線圖比較兩類樣本的某個(gè)細(xì)胞比例差異 比較直觀，但是缺點(diǎn)在于如果單細(xì)胞樣本個(gè)數(shù)過(guò)少且異質(zhì)性大，導(dǎo)致很難有統(tǒng)計(jì)學(xué)顯著意義 2.R o/e 比值 好多文章都有用這個(gè)，我的...
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單細(xì)胞細(xì)胞比例分析方法列舉 -
沒(méi)有什么不是認(rèn)真搞不定的?。。?/div>
monocle 2擬時(shí)序分析monocle做擬時(shí)序分析首先要構(gòu)建CDS需要3個(gè)矩陣：expr.matrix、pd、fd，其次將Seurat中的對(duì)象轉(zhuǎn)換為monocle識(shí)別的對(duì)象。然后選擇想要做擬時(shí)序依據(jù)...
個(gè)人博客: xuzhougeng.top (隨緣訪問(wèn))MSKCC Research Associate<br>別趕不上野心，又辜負(fù)了努力周運(yùn)來(lái)，男，長(zhǎng)大了才會(huì)遇到的帥哥，穩(wěn)健，瀟灑，大方，靠譜。一段生信緣，一棵技能樹。生信技能樹核心成員，單細(xì)胞天地供稿人，簡(jiǎn)書創(chuàng)作者，單細(xì)胞數(shù)據(jù)科學(xué)家。利用BiocManager安裝R包1.首先安裝BiocManager包如果你的R版本為3.6版本，請(qǐng)將版本號(hào)設(shè)置為version = "3.11"version = "3.12"適用于R 4.0.0 2.通過(guò)...
公眾號(hào) R語(yǔ)言數(shù)據(jù)分析指南，歡迎大家關(guān)注中山大學(xué)中山醫(yī)學(xué)院-基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)博士在讀<br>歡迎關(guān)注個(gè)人公眾號(hào)<br><br>公眾號(hào)：bioinfomics<br>博客：<a href="https://links.jianshu.com/go?to=https%3A%2F%2Fdongwei1220.github.io%2F" target="_blank">https://dongwei1220.github.io/</a><br>
單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組|Seurat 4.0 使用指南后臺(tái)有讀者翻到了一年前發(fā)的文獻(xiàn)解讀，請(qǐng)教了一下文章的圖的做法。正好前段時(shí)間剛做過(guò)單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組分析，今天就給大家介紹一下常用工具Seurat的用法。 Seurat 4.0 使用...
