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Seurat 新版教程：分析空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)隨著轉(zhuǎn)錄組技術(shù)的發(fā)展，空間轉(zhuǎn)錄組已經(jīng)正式走向商業(yè)化時代，作為單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析的工具箱的Seurat與時俱進(jìn)，也相應(yīng)地開發(fā)了空間轉(zhuǎn)錄組分析的一套函數(shù)，讓我們跟隨卑微小王看看Seu...
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淺淺的學(xué)習(xí)歷程<br>生信新手，打工人，搬運(yùn)工。<br>像王子文一樣財務(wù)自由，才可實(shí)現(xiàn)生育自由<br>像李子柒一樣把一件事情做到極致，才可實(shí)現(xiàn)職業(yè)自由
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困擾的batch effect一、什么是批次效應(yīng) 批次效應(yīng)（batch effect），表示樣品在不同批次中處理和測量產(chǎn)生的與試驗(yàn)期間記錄的任何生物變異無關(guān)的技術(shù)差異。批次效應(yīng)是高通量試驗(yàn)中常見的變異來源...
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docker 存儲導(dǎo)致 /dev/sdb2磁盤溢滿linux 系統(tǒng)報錯： cannot create temp file for here-document: No space left on device，顯然是磁盤完全占...
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R繪圖：ggplot2繪制火山圖火山圖是測序分析報告中最為核心的圖片之一。繪制火山圖的方法有許多，Excel和第三方軟件等，本文主要運(yùn)用ggplot2和ggrepel兩個R包演示[1][2]。橫坐標(biāo)為Fol...
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ubuntu 安裝之 apt update 報錯系統(tǒng)安裝體驗(yàn)建議： 1. ubuntu server 18.04 版本安裝時候，選擇安裝軟件步驟: 安裝ssh-server，便于遠(yuǎn)程登錄操作，方便進(jìn)一步配置； 2. 個人...
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周運(yùn)來，男，長大了才會遇到的帥哥，穩(wěn)健，瀟灑，大方，靠譜。一段生信緣，一棵技能樹。生信技能樹核心成員，單細(xì)胞天地供稿人，簡書創(chuàng)作者，單細(xì)胞數(shù)據(jù)科學(xué)家。
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<a href="https://links.jianshu.com/go?to=https%3A%2F%2Fwww.cnblogs.com%2Fwangprince2017%2F" target="_blank">https://www.cnblogs.com/wangprince2017/</a> 博客園<br><br><a href="https://links.jianshu.com/go?to=https%3A%2F%2Fblog.csdn.net%2Fu010608296" target="_blank">https://blog.csdn.net/u010608296</a> CSDN<br><br>學(xué)者網(wǎng)<a href="https://links.jianshu.com/go?to=http%3A%2F%2Fwww.scholat.com%2Fwangchuang" target="_blank">http://www.scholat.com/wangchuang</a><br><br>研究之門ReseearchGate<br><a href="https://links.jianshu.com/go?to=https%3A%2F%2Fwww.researchgate.net%2Fprofile%2FWang_Chuang9" target="_blank">https://www.researchgate.net/profile/Wang_Chuang9</a><br><br><br><a href="https://links.jianshu.com/go?to=http%3A%2F%2Fbbs.sciencenet.cn%2Fhome.php%3Fmod%3Dspace%26uid%3D944416%26view%3Dwc12436109" target="_blank">http://bbs.sciencenet.cn/home.php?mod=space&uid=944416&view=wc12436109</a> 科學(xué)網(wǎng)
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Illumina測序化學(xué)原理該文章是對 https://www.youtube.com/watch?v=VvS8NEJGxnM 這個視頻進(jìn)行的總結(jié)梳理。 特此感謝陳巍老師，更多關(guān)于基因的內(nèi)容請關(guān)注微信公...
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生信基礎(chǔ)知識復(fù)習(xí)之測序劉小澤寫于18.11.25每學(xué)習(xí)一遍之前的知識，總能從不同角度獲取一些觀點(diǎn)，然后擴(kuò)增自己的知識庫，這就是“知識迭代”這次我也就是想到哪寫到哪，把自己認(rèn)為重要的內(nèi)容梳理下，用Q...
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一般同一批樣本送去測序，測序使用的DNA材料和測序深度基本比較接近（PCR系統(tǒng)偏差穩(wěn)定），這樣的前提下，我認(rèn)為RPKM和FPKM還是還是具有可比較性的。
為什么說FPKM和RPKM都錯了？
這本是三年多之前我發(fā)在公眾號上的一篇舊文，一些偶然的機(jī)會，發(fā)現(xiàn)不少朋友也在討論這個問題，因此我重新做了梳理并發(fā)出來。這樣的討論是有益的，放在今天也不過時，我也愿意和更多的朋友...
