本文將介紹DNA、RNA的保存策略,順帶提及細(xì)胞的保存方法。 一、DNA的保存 DNA為雙螺旋結(jié)構(gòu),具有較高穩(wěn)定性,但在野外樣品采集的過程中仍需注意,以防降解。下面介紹以測序...
本文將介紹DNA、RNA的保存策略,順帶提及細(xì)胞的保存方法。 一、DNA的保存 DNA為雙螺旋結(jié)構(gòu),具有較高穩(wěn)定性,但在野外樣品采集的過程中仍需注意,以防降解。下面介紹以測序...
本文章首次發(fā)表于2018年7月29號 天氣預(yù)報(bào)的溫度一爬上30度,我就不是我了,我大概是個(gè)李哈哈小姐干。昨天去爬山,想尋找點(diǎn)新的有趣的植物,然而高溫讓我停止思考。 滿腦子就想...
來自researchgate[https://www.researchgate.net/post/Why_do_Fst_values_from_Arlequin_differ...
本文章意在列舉一些植物分類學(xué)研究過程中常用的互聯(lián)網(wǎng)在線資源。 1. 植物志 1.1 國內(nèi)植物志 中國植物志[http://frps.iplant.cn/] Flora of ...
00 寫在前面 測序后公司交付數(shù)據(jù)時(shí),一般會(huì)提供質(zhì)控后的clean data和后續(xù)的基礎(chǔ)分析結(jié)果。因?yàn)榭赡苄枰约簛磉M(jìn)行數(shù)據(jù)的預(yù)處理,記得一定要拿回raw data,同時(shí)弄清...
來源: 群體遺傳進(jìn)化名詞解釋[https://www.omicsclass.com/article/1337]部分概念未經(jīng)確認(rèn),注意甄別 1. 等位基因頻率 等位基因頻率是群...
一. 簡介 Snippy[https://github.com/tseemann/snippy]是一款用于SNP檢測的軟件,可以通過分析得到核心SNP,進(jìn)行比對構(gòu)建進(jìn)化樹。 ...
這篇文章主要介紹了Shell中的${}、##和%%使用范例,覺得不錯(cuò),保留下來。 假設(shè)我們定義了一個(gè)變量為: 可以用${ }分別替換得到不同的值: 代碼如下: 記憶的方法為:...
參考:htop - 強(qiáng)大的進(jìn)程管理工具[https://blog.51cto.com/13683137989/1893953]top與htop字段解釋[https://www...
參考http://m.itdecent.cn/p/78b56fa23255[http://m.itdecent.cn/p/78b56fa23255] 需要嘗試St...
一次簡化基因組數(shù)據(jù)分析實(shí)戰(zhàn) 盡管目前已經(jīng)有大量物種基因組釋放出來,但還是存在許多物種是沒有參考基因組。使用基于酶切的二代測序技術(shù),如RAD-seq,GBS,構(gòu)建遺傳圖譜是研究...
對于各位小伙伴來說,無論是自己獨(dú)立進(jìn)行高通量測序數(shù)據(jù)分析,還是解讀公司的測序結(jié)果,一個(gè)必須要面對的情況就是高通量測序數(shù)據(jù)的質(zhì)量控制,又稱Quality Control。照顧到...
首先利用muscle進(jìn)行多序列比對:“muscle -in 序列文件.fasta -out 輸出的比對結(jié)果文件.fasta”。 再利用raxml進(jìn)行進(jìn)化樹構(gòu)建:“/pub/a...
Github/mmatschiner的phylogenetic & phylogenomic學(xué)習(xí)教程記錄【一】多序列比對;核算替換模型的選擇;最大似然法建樹的學(xué)習(xí) [TOC]...
來自 【一些小常識(shí)】Linux文件目錄的通配符用法/*[https://www.cnblogs.com/muzipaopao/p/11310958.html] 1.單獨(dú)的“*...
使用phylosuite下載的多個(gè)序列保存在一個(gè)文件中,名為sequence.fas可以使用seqkit將其分割為只包含一條序列的單個(gè)文件 此處使用的是split命令 在本次...