SFS的基本理解、介紹的一篇文章：https://theg-cat.com/tag/joint-sfs/[https://theg-cat.com/tag/joint-sfs...
IP屬地：新疆
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種群動態(tài)歷史評估方法之 SFS（Site/Allele Frequency Spectrum） -
jcvi畫兩物種的共線性圖參考：https://github.com/tanghaibao/jcvi/wiki/MCscan-(Python-version)[https://github.com/t...
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基因家族擴張與收縮分析及物種進(jìn)化樹構(gòu)建（上）一、數(shù)據(jù)準(zhǔn)備 首先，選取不同物種的Protein數(shù)據(jù)集：Arabidopsis_thaliana.fa；Citrus_grandis.fa；Dimocarpus_longan...
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「基因組學(xué)」使用CAFE進(jìn)行基因家族擴張收縮分析環(huán)境準(zhǔn)備 安裝軟件: 參考「基因組學(xué)」使用OrthoFinder進(jìn)行直系同源基因分析 安裝OrthoFinder，然后再安裝CAFE 數(shù)據(jù)準(zhǔn)備: 一共會分析mouse, r...
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【比較基因組學(xué)】基因家族擴張與收縮分析前言：因為最近陸陸續(xù)續(xù)接手了幾個物種的基因組項目，這也是生信分析中很大的一塊。其中最基礎(chǔ)的是組裝和注釋（當(dāng)然我們實驗室也做組裝方法學(xué)的研究）?，F(xiàn)在隨著很多物種基因組的發(fā)表，純...
