關于該軟件的計算可選參數(shù)以及結果文件的解讀，見前三篇分享： 序列比對軟件 MUMmer 快速上手（一）[http://m.itdecent.cn/writer#/not...
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序列比對軟件 MUMmer 結果可讀化處理（四）
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主成分分析-PCA圖的優(yōu)化（R語言）
R語言的主成分分析（PCA）詳解和帶聚類的PCA圖繪制 最近有個老師在整理文章數(shù)據(jù)，由于分組較多，想展示PCA圖，說明不同分組的差異，公司默認給出的PCA圖比較樸素，想做的好...
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rehh：單倍體/單倍型群體間選擇信號分析（基于selective sweep）本文介紹的方法都是基于Extended Haplotype Homozygosity (EHH)概念，由SABETI 等人在 2002年提出。簡單來說，根據(jù)selective...
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nextflow中文文檔（3）：Nextflow腳本（Nextflow scripting）
Nextflow scripting Nextflow腳本語言是Groovy編程語言的擴展。Groovy是用于Java虛擬機的強大編程語言。Nextflow語法專門用于以聲明...
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生信-爬蟲 | 異步爬取網(wǎng)頁表格數(shù)據(jù)寫在前面 前段時間，師姐讓爬取一些LncRNA的一些信息，具體在下面的網(wǎng)站中：LncBook：https://ngdc.cncb.ac.cn/lncbook/lncrnas[...
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Docker封裝生物信息學甲基化流程
CpG CHG CHH含義p代表磷酸二酯鍵，CpG指的是甲基化的C的下游是1個G堿基。H代表除了G堿基之外的其他堿基，即A, C, T中的任意一種，CHG代表甲基化的C下游...
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Conda小事項
1. 更新conda $ conda update conda 2. 如果不希望在啟動時激活conda的基本環(huán)境 set the auto_activate_base par...
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Orthofinder運行結果文件解讀OrthoFinder結果文件 運行標準OrthoFinder會產(chǎn)生一系列文件：直系同源組、直系同源、基因樹、物種樹、基因復制事件、比較基因組學數(shù)據(jù)。結果文件在所分析物種的....
