最近在做Affy的SNP 6 芯片家系數據做連鎖分析，找家系的致病性基因，拿到的是 *.CEL 文件，然后用MERLIN做連鎖分析，在準備pe...
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GenomeWideSNP_6.cdf GenomeWideSNP_6.birdseed-v2.models -
T細胞受體庫測序T細胞受體是T細胞識別靶細胞表面特異性抗原的蛋白分子，由α鏈和β鏈（分別由TRA和TRB編碼）或者γ鏈和δ 鏈（分別由TRG和TRD編碼）構成的...
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Seurat重要命令匯總
參考：https://satijalab.org/seurat/articles/essential_commands.html[https:/...
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Seurat包其中的FindIntegrationAnchors函數解析
在用Seurat包做多樣本整合的時候，我們通常采用兩種方式：（1）merge的方式（2）FindIntegrationAnchors的方式整合這...
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Pysam BAM操作SAM/BAM/CRAM files class pysam.AlignmentFile filepath_or_object 既可以是 文件路...
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徒手學習facets CNV分析結果Copy number variation analysis - facets facets 是存儲在 GitHub 上的R包。 factes...
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R語言讀寫R格式文件2021.2.24
1、讀取R格式文件 1.1 讀寫RDS格式文件 1.1.1 導出RDS文件 1.1.2 讀取RDS文件 直接雙擊已有的RDS文件，用Rstudi...
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腫瘤TMB的計算原理和數學模型
美國FDA目前批準了3個檢測腫瘤TMB（ tumor mutation burden）的方法：Omisc Core WES、MSK-IMPACT...
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（避坑）samtools bedcov 和 bedtools coverage 的區(qū)別
今天在Biostar上看到了這個關于samtools bedcov vs. bedtools coverage 問題的討論（https://w...
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