0.準(zhǔn)備輸入數(shù)據(jù) 可以是矩陣 行是一邊，列是一邊，矩陣正文的數(shù)字表示連接的強(qiáng)度。 可以是tidy數(shù)據(jù)框 一行是一個(gè)連接關(guān)系，第一列和第二列是要連...
投稿
收錄了208篇文章 · 366人關(guān)注
-
弦圖，管他中不中用，反正高大上 -
想自己搭建服務(wù)器，永久運(yùn)行網(wǎng)站？一個(gè) U 盤大小的樹莓派就夠了！
No.1 前言 由于本人在這段時(shí)候，看到了一個(gè)叫做樹莓派的東東，初步了解之后覺得很有意思，于是想把整個(gè)過程記錄下來。 No.2 樹莓派是什么？ ...
-
使用IGV簡單繪制甲基化分布圖廢話不多說，直接簡單粗暴的開始吧 導(dǎo)入基因組 導(dǎo)入基因組文件：Genomes→load geome from file→選擇"reference...
-
群體結(jié)構(gòu)——PCA分析概念 PCA（principal components analysis）即主成分分析。主成分分析也稱主分量分析，旨在利用降維的思想，把多指標(biāo)轉(zhuǎn)...
-
計(jì)算bam文件中比對(duì)上基因組的reads以及合并多個(gè)bam文件
參考文章：1.如何統(tǒng)計(jì)BAM文件中的reads數(shù)2.Samtools常用命令的總結(jié) 當(dāng)你有很多個(gè)bam文件時(shí)，想知道這些bam文件里有多少個(gè)比對(duì)...
-
序列比對(duì)后計(jì)算變異位點(diǎn)，有效位點(diǎn)，核苷酸多樣性variable sites informative sites nucleotide diversity 信息位點(diǎn)的定義：在兩個(gè)及以上分類單元...
-
讀文章重復(fù)結(jié)果：使用DnaSp軟件計(jì)算核苷酸多態(tài)性Pi(nucleotide diversity)
葉綠體基因組的文章中通常會(huì)有一小部分內(nèi)容是運(yùn)用DnaSp軟件來進(jìn)行核苷酸多態(tài)性π分析，斷斷續(xù)續(xù)看了也好長時(shí)間了，今天終于重復(fù)出了結(jié)果，簡單記錄自...
-
根據(jù)vcf文件計(jì)算SNP密度并用circlize可視化結(jié)果參考 收集vcftools所有用法 命令 100000 是指定窗口長度--out 是輸出文件的前綴 使用R語言中的circlize包畫圖 參考 ...
-
全基因組關(guān)聯(lián)分析（GWAS）學(xué)習(xí)筆記——3.1參考資料 https://github.com/MareesAT/GWA_tutorial/ 全基因組關(guān)聯(lián)分析學(xué)習(xí)資料（GWAS tutoria...
-
如何利用NR庫快速進(jìn)行物種鑒定
作者：charon審稿：童蒙編輯：angelica 引言 在做基因或者蛋白質(zhì)功能注釋的時(shí)候，NR數(shù)據(jù)庫包含非常重要的信息。但是有沒有人跟我一樣遇...
{var%20f='http://v.t.sina.com.cn/share/share.php?appkey=1881139527',u=z||d.location,p=['&url=',e(u),'&title=',e(t||d.title),'&source=',e(r),'&sourceUrl=',e(l),'&content=',c||'gb2312','&pic=',e(p||'')].join('');function%20a(){if(!window.open([f,p].join(''),'mb',['toolbar=0,status=0,resizable=1,width=440,height=430,left=',(s.width-440)/2,',top=',(s.height-430)/2].join('')))u.href=[f,p].join('');};if(/Firefox/.test(navigator.userAgent))setTimeout(a,0);else%20a();})(screen,document,encodeURIComponent,'','','https://upload.jianshu.io/collections/images/557754/timg.jpeg', '推薦專題《生信相關(guān)》（ 分享自 @簡書 ）','http://m.itdecent.cn/c/273c552ffaf4?utm_campaign=maleskine&utm_content=collection&utm_medium=reader_share&utm_source=weibo','頁面編碼gb2312|utf-8默認(rèn)gb2312'));){kind=link}