題目出自【生信技能樹(shù)】公眾號(hào)文章：2011年的表達(dá)芯片分析和2019年的區(qū)別要求：走GEO標(biāo)準(zhǔn)分析流程分析GSE27447 代碼主要復(fù)制于Jim...
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【生信技能樹(shù)】2020-01-08作業(yè)：GEO挖掘標(biāo)準(zhǔn)流程分析GSE27447 -
TCGA下載相關(guān)資料(update-1/3)5.ICGC數(shù)據(jù)庫(kù)如何下載癌癥數(shù)據(jù) 4.一文搞懂TCGA中的分析結(jié)果如何來(lái) 介紹TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)結(jié)果，如何處理得到的。 3.MAF格式及其TCGA...
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基因ID轉(zhuǎn)換及富集分析 | org.Hs.eg.db clusterProfiler僅針對(duì)人類而言。雖然一直對(duì)GO和KEGG不感冒，但流程化的分析還是要做的。主要包括兩部分： 將基因編號(hào)轉(zhuǎn)為ENTREZID(具有唯一性）：基因編...
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FDR 和 q-value
| 轉(zhuǎn)載自G. Corey Shan 的 FDR 和 q-value 最近在做一個(gè)肝癌預(yù)測(cè)的項(xiàng)目，建模使用的數(shù)據(jù)源在The Cancer Gen...
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GO，KEGG，DO富集分析這是我聽(tīng)B站鯪魚(yú)不會(huì)飛視頻（GO，KEGG，DO富集分析）里的筆記哦~當(dāng)然有的地方加上的是我自己的理解，如果哪里和視頻上講的不一樣那是我自己發(fā)揮...
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