本文首發(fā)于“生信補給站” https://mp.weixin.qq.com/s/k7yzk9hPX3Bi-ohAo83ZYw還有其他 R統(tǒng)計 ...
投稿
收錄了6篇文章 · 94人關注
-
deconstructSigs|探尋cosmic的獨特“氣質”-mutation signature ！
-
R|生存分析 - KM曲線 ，值得擁有姓名和顏值
生存分析作為分析疾病/癌癥預后的出鏡頻率超高的分析手段，而其結果展示的KM曲線也必須擁有姓名和顏值！ 生存分析相關推文： 生存分析和KM曲線：R...
-
多種批次效應去除的方法比較-轉自生信技能樹
多種批次效應去除的方法比較 原創(chuàng) 生信技能樹 前面我在生信技能樹推文：你確定你的差異基因找對了嗎？ 提出了文章的轉錄組數(shù)據(jù)的60個樣品并沒有按照...
-
折騰了許久才復現(xiàn)出的WGCNA圖-GSE106292你值得擁有
前些天老大布置了WGCNA的作業(yè)：下載GSE106292 數(shù)據(jù)集的 Excel表格如何讀入R里面，做出作者文章中那樣的圖，但是分組很復雜，需要去...
-
STEP6:WGCNA相關性分析因為樣本數(shù)量比較可觀，所以可以進行WGCNA分析。這里是并不需要選取所有的基因來做WGCNA分析，挑選的標準可以是top變異程度大的基因集合，或...
-
[2] CNS 腳本收集 ATAC-seqhttps://github.com/ChristiaenLab/ATAC-seq對應文章連接
-
[1] Science 腳本收集Comparing ELMER TCGA-BRCA and ATAC-seq inference linkages of loci (DNA m...
-
GEO數(shù)據(jù)庫挖掘—生信技能樹B站視頻以下是B站生信技能樹GEO數(shù)據(jù)庫挖掘的課程筆記 主要內容及學習目的： 介紹GEO數(shù)據(jù)庫：了解數(shù)據(jù)存放位置； 介紹GSE項目的3種下載方式； 介紹...
-
GEO和TCGA數(shù)據(jù)挖掘生物信息文章解讀（宮頸癌） TCGA GEO
今天我們介紹一篇稍高分數(shù)的文章，來看一下生信挖掘文章如何發(fā)更高檔次的雜志。這篇文章是利用GEO和TCGA數(shù)據(jù)挖掘宮頸癌預后相關的關鍵基因，201...
-
maftools|TCGA腫瘤突變數(shù)據(jù)的匯總，分析和可視化
本文首發(fā)于公眾號“生信補給站”，https://mp.weixin.qq.com/s/WG4JHs9RSm5IEJiiGEzDkg 之前介紹了使...
{var%20f='http://v.t.sina.com.cn/share/share.php?appkey=1881139527',u=z||d.location,p=['&url=',e(u),'&title=',e(t||d.title),'&source=',e(r),'&sourceUrl=',e(l),'&content=',c||'gb2312','&pic=',e(p||'')].join('');function%20a(){if(!window.open([f,p].join(''),'mb',['toolbar=0,status=0,resizable=1,width=440,height=430,left=',(s.width-440)/2,',top=',(s.height-430)/2].join('')))u.href=[f,p].join('');};if(/Firefox/.test(navigator.userAgent))setTimeout(a,0);else%20a();})(screen,document,encodeURIComponent,'','','https://upload.jianshu.io/collections/images/1824813/0317572Ql.jpg', '推薦專題《TCGA/GEO/SEER 公共數(shù)據(jù)庫挖掘》（ 分享自 @簡書 ）','http://m.itdecent.cn/c/5fa84b9d6dc5?utm_campaign=maleskine&utm_content=collection&utm_medium=reader_share&utm_source=weibo','頁面編碼gb2312|utf-8默認gb2312'));){kind=link}