安裝[https://zhuanlan.zhihu.com/p/58803491]下載已知蛋白結(jié)構(gòu)[http://blog.sciencenet...
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Pymol使用
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轉(zhuǎn)錄本差異分析（salmon）
Swimming downstream: statistical analysis of differential transcript usa...
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nanopore 分析流程
本文轉(zhuǎn)載自知乎 nanopor技術(shù)專欄[https://zhuanlan.zhihu.com/p/102392867]，修改了其中部分代碼。 單...
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IsoformSwitchAnalyzeR 可變剪切分析曾經(jīng)我用 rMATS 進行可變剪切分析，現(xiàn)在我覺得 IsoformSwitchAnalyzeR 更香。 IsoformSwitchAnalyze...
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轉(zhuǎn)錄本差異DRIMSeq使用
官方文件[https://bioconductor.org/packages/release/bioc/vignettes/DRIMSeq/in...
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每周文獻-190330-DTU分析及轉(zhuǎn)錄組de novo拼接解析等文獻題目 Relative Abundance of Transcripts (RATs): Identifying differential ...
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gtf轉(zhuǎn)化為bed在igv可視化
bedops可以將gtf較為方便轉(zhuǎn)化為bed文件，但是對在igv中展示基因結(jié)構(gòu)不太適合采用如下python代碼可以很好解決問題原始鏈接代碼拷貝如下
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蛋白三級結(jié)構(gòu)預測（I TASSER）獻給初學者：手把手教你在線預測蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)I TASSER算是比較好的華人教授開發(fā)的一個預測軟件，在線可以直接分析。但是需要等待挺長時間并且一次只...
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Nanopore base call
使用GuppyEarly downstream analysis components such as **barcoding/demultip...
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Nanopore QC
nanopore QC有好幾種方法簡單來說需要base call 后的sequencing_summary.txt文件pycoQC看起來比較酷炫...
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