單行命令，化繁為簡，重劍無鋒，大巧不工。接下來學(xué)習(xí)生信實(shí)用單行命令。 基礎(chǔ)awk和sed命令 sed: stream editor流編輯器 提取...
投稿
收錄了37篇文章 · 36人關(guān)注
-
【linux】單行命令-第2部分：Bioinformatics one-liners
-
grep -v、-e、-E
概述 在Linux的grep命令中如何使用or，and，not操作符呢？ 其實(shí)，在grep命令中，有or和not操作符的等價(jià)選項(xiàng)，但是并沒有g(shù)r...
-
Linux： 數(shù)據(jù)處理三劍客之a(chǎn)wk前言 ??對于用Linux來處理數(shù)據(jù)的用戶來說，應(yīng)該都知道Linux處理數(shù)據(jù)的三個(gè)強(qiáng)有力的命令awk、sed、grep——人稱三劍客。那么今天想...
-
耗時(shí)很長的程序忘加nohup就運(yùn)行了怎么辦？
在NGS基礎(chǔ)：測序原始數(shù)據(jù)下載一文中提到可以使用SRA-toolkit中的命令fastq-dump從NCBI下載原始測序數(shù)據(jù)，命令如下。 這個(gè)代...
-
【生信技能樹】sam和bam格式文件的shell小練習(xí)【生信技能樹】sam和bam格式文件的shell小練習(xí) LINUX練習(xí)題 1) 統(tǒng)計(jì)共多少條reads(pair-end reads這里算一條)...
-
awk 進(jìn)階（兩文件的交集和差集）
簡單的語句 兩文件的交集和差集 例子 aaa.txt文本 bbb.txt 求aaa.txt和bbb.txt的差集 awk 交集 NR表示已經(jīng)處理...
-
文本處理命令awk 實(shí)例學(xué)習(xí)參考文章源地址awk命令是Linux系統(tǒng)里非常強(qiáng)大和功能豐富的文本行處理工具命令，使用方法簡單，但是功能豐富，處理文本的速度也非?？?。awk是Lin...
-
[轉(zhuǎn)]snakemake使用筆記
snakemake是一個(gè)用來編寫任務(wù)流程的工具，用python編寫的，因此其執(zhí)行的流程腳本也比較通俗易懂，易于理解。 一、從一個(gè)簡單的例子開始 ...
-
linux視頻 文本處理 筆記
聽老大嗶哩嗶哩視頻中的linux文本處理的部分，其中講到三駕馬車（grep、awk、sed）部分很快就迷糊了，工欲善其事，必先利其器。這幾種文本...
-
Ubuntu18.04.2LTS安裝、配置、美化Ubuntu18.04.2LTS安裝、配置、美化 安裝準(zhǔn)備 準(zhǔn)備Ubuntu18.04鏡像 關(guān)閉Secure Boot 硬盤分區(qū) 硬盤一般分為I...
{var%20f='http://v.t.sina.com.cn/share/share.php?appkey=1881139527',u=z||d.location,p=['&url=',e(u),'&title=',e(t||d.title),'&source=',e(r),'&sourceUrl=',e(l),'&content=',c||'gb2312','&pic=',e(p||'')].join('');function%20a(){if(!window.open([f,p].join(''),'mb',['toolbar=0,status=0,resizable=1,width=440,height=430,left=',(s.width-440)/2,',top=',(s.height-430)/2].join('')))u.href=[f,p].join('');};if(/Firefox/.test(navigator.userAgent))setTimeout(a,0);else%20a();})(screen,document,encodeURIComponent,'','','https://upload.jianshu.io/collections/images/1666748/crop1537839766355.jpg', '推薦專題《Shell程序編寫》（ 分享自 @簡書 ）','http://m.itdecent.cn/c/a2fa8e48d519?utm_campaign=maleskine&utm_content=collection&utm_medium=reader_share&utm_source=weibo','頁面編碼gb2312|utf-8默認(rèn)gb2312'));){kind=link}