前言 通過學(xué)習(xí)前面幾個模塊，我們已經(jīng)發(fā)現(xiàn)了基于多組學(xué)數(shù)據(jù)找出的乳腺癌各亞型間具有非常顯著的分子差異，而我們?nèi)绻肷钊胪诰蚱浔澈髾C(jī)制，就需要找出差...
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MOVICS系列教程(三) RUN Module
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MOVICS系列教程(四) 示例文章解讀
說在前面 本期推文是MOVICS包系列教程的最后一篇，Immugent來用一篇已經(jīng)發(fā)表的SCI來解讀一下如何在實(shí)際文章中使用MOVICS包。 首...
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MOVICS系列教程(二) COMP Module
前言 今天我們來演示MOVICS包的第二個模塊，在上一篇推文中：MOVICS系列教程(一) GET Module[https://mp.weix...
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MOVICS系列教程(一) GET Module
前言 Immugent在之前的推文：整合多組學(xué)數(shù)據(jù)進(jìn)行分型之MOVICS[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=Mz...
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用小鼠數(shù)據(jù)集做單細(xì)胞數(shù)據(jù)GSVA之紀(jì)念第一次寫簡書
作為一名基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)生，大家有沒有這樣的苦惱，那就是拿不到臨床病人的樣本，只能做小鼠?。?！做就做唄，關(guān)鍵是好多基因集都是針對人來做的，于是乎做小鼠的...
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IOBR:一個R包帶你走進(jìn)數(shù)據(jù)挖掘的殿堂
鑒于前一段時間有小伙伴私聊 Immugent 說生信寶庫是不是專門只寫單細(xì)胞相關(guān)的推文呀，其實(shí)，這只是湊巧最近發(fā)的都是單細(xì)胞相關(guān)的。雖然近幾年產(chǎn)...
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富集分析天花板之ClusterProfiler4說在前面 在國內(nèi)做生信的小伙伴或多或少都聽過一個大名鼎鼎的名字---Y叔，想當(dāng)初小編初入生信大門時還專門百度查了一下，他就是南方醫(yī)科大學(xué)生物信息...
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單細(xì)胞基因集打分實(shí)操之irGSEA
Immugent在推文一文帶你了解單細(xì)胞數(shù)據(jù)基因集打分的所有算法[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzI4Mj...
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基于單細(xì)胞數(shù)據(jù)進(jìn)行Bulk定量之MuSiC
前言 Immugent最近在讀文獻(xiàn)時一直遇到各種利用deconvolution基于單細(xì)胞參考數(shù)據(jù)集進(jìn)行bulk細(xì)胞定量的文章，于是專門系統(tǒng)的學(xué)習(xí)...
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