任意基因的任意分組比較是生信技能樹[生信爆款入門課程]TCGA數(shù)據(jù)挖掘部分提到的一個重點。為拓展課堂所學知識，現(xiàn)在對其做下練習鞏固和總結。 1....
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TCGA數(shù)據(jù)挖掘入門---任意基因的任意分組比較 -
TCGA數(shù)據(jù)挖掘（miRNA）+細胞功能實驗發(fā)文思路今天分享一篇TCGA數(shù)據(jù)挖掘（miRNA）+細胞功能實驗發(fā)文思路的文章，這篇于2021年2月21日在World J Surg Oncol上發(fā)表。...
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TCGA數(shù)據(jù)挖掘二：基因差異分析加載之前下載并保存的文件 注意：這里介紹的差異分析方法有三種，其中l(wèi)imma是最經(jīng)典的，但是limma是必須接受log之后的值，才能正確算出差異...
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初學者R語言：熱圖基礎畫法及個性化調(diào)整詳解熱圖（Heatmap）：用顏色變化直觀的表達數(shù)據(jù)之間差異的圖，是對實驗數(shù)據(jù)進行質(zhì)制和差異數(shù)據(jù)的展現(xiàn)，是數(shù)據(jù)挖掘類文章的標配。 例如上圖，每個小方...
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TCGA數(shù)據(jù)挖掘九：lasso回歸加載表達矩陣和生存數(shù)據(jù) 進行l(wèi)asso回歸，找到最佳建模位置 再用得到的最佳的位置去建模 判斷預測結果的準確性 后面這段是補充，可以不用看了。。...
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TCGA數(shù)據(jù)挖掘八：根據(jù)基因類型挑選lincRNA的基因讀取基因?qū)愋偷臄?shù)據(jù) 讀取表達矩陣 把表達矩陣的中對應的lincRNA的基因挑選出來 最后 感謝jimmy的生信技能樹團隊！ 感謝導師岑洪老師...
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