概覽 Title：From GWAS to Function: Using Functional Genomics to Identify th...
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post-GWAS era文章分享3-From GWAS to Function: Using Functional Genomics to Identify the Mechanisms Un... -
三維基因組組織結構在免疫細胞命運分化和功能中的作用（下篇）摘要 免疫細胞的分化、發(fā)育和激活需要轉錄程序的精確和協調控制。基因組的三維（3D）組織結構已成為染色質狀態(tài)、轉錄活性和細胞身份決定的重要調節(jié)因子...
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三維基因組組織結構在免疫細胞命運分化和功能中的作用（上篇）摘要 免疫細胞的分化、發(fā)育和激活需要轉錄程序的精確和協調控制?；蚪M的三維（3D）組織結構已成為染色質狀態(tài)、轉錄活性和細胞身份決定的重要調節(jié)因子...
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干貨！Hi-C研究抽象變具象，就讀這篇！2009年，Job Dekker首次開發(fā)出Hi-C技術，實現了全基因組單位內染色體片段間相互作用的捕獲。高通量染色體三維構象捕獲技術Hi-C（H...
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3D百文6-TAD識別計算方法的比較Comparison of computational methods for the identification of topologica...
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Chicdiff使用Capture Hi-C 是一種檢測至少在一端涉及感興趣的 DNA 區(qū)域，如基因啟動子染色體相互作用的有效方法。 Chicdiff，是一個用于捕...
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HI-C數據分析 pipeline（二：數據格式轉換）
由于HIC數據目前很難用一個軟件就能將全套流程全部分析完，從數據預處理到后續(xù)的TAD計算，loop計算等需要用到眾多軟件，但是在數據格式方面，各...
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HI-C數據分析 pipeline（一：上游數據預處理）
Hi-C fastq data to valid pair and matrix data format transition.本文總結了Hi-...
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HiCExplorer使用
HiCExplorer[https://hicexplorer.readthedocs.io/en/latest/index.html] 1、數...
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3D百文--3D基因組中的TAD是否是跨物種保守的？沒想到所謂的TAD跨物種保守的證據是如此不足的，感覺有點拍腦袋和人云亦云的意思 不過后面還有幾篇新的幾篇文章針對這篇文章提出的問題做了點工作 A...
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