Seqkit小工具處理序列、提取序列ID

Seqkit是一款專門處理fsata/q序列文件的軟件，由go語言編寫，功能比較完善，軟件使用也很穩(wěn)定。

優(yōu)點
1.能夠非常全面的處理fasta/q文件，運行速度超快的序列工具
2.支持多平臺(Linux/Windows/macOS)使用,是一款輕量級軟件
3.可以做到開箱即用（無依賴，無需編譯，無需配置）

安裝

conda install -c bioconda seqkit

參數(shù)

參數(shù)

基本用法

seqkit seq test.fa#查看 fa文件
seqkit translate test.fa > protein.fa #轉化為蛋白序列
seqkit translate test.fa --trim >protein.fa #去除*
seqkit grep -f test_id.txt test.fa -o new_test.fa #根據(jù)id提取序列
seqkit seq hairpin.fa.gz -n -i  #展示序列ID
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