噬菌體的分離是噬菌體生物學(xué)特性等后續(xù)研究的基礎(chǔ)，目前有多種分離技術(shù)，其選擇主要是取決于后續(xù)的用途。本文討論了噬菌體分離的一般原理以及從各種來(lái)源獲得純噬菌體分離物的技術(shù)。
先來(lái)一波名詞解釋：
Bacteriocins 細(xì)菌素：
有細(xì)菌產(chǎn)生的有毒蛋白質(zhì)，可以殺死或抑制周圍其他細(xì)菌的生長(zhǎng)。
Burst size 噬菌體裂解量：
由受感染的一個(gè)細(xì)胞通過(guò)裂解所釋放的平均噬菌體數(shù)。
Chronic infection 慢性感染：
寄主細(xì)胞不通過(guò)裂解的方式，而是通過(guò)細(xì)胞膜擠出將子代噬菌體釋放到體外。
Double agar overlay 雙瓊脂覆蓋法（DLA）：
一種產(chǎn)生可視化噬菌斑（plaque）的試驗(yàn)，將宿主細(xì)胞和噬菌體接種在的軟瓊脂中，然后倒在硬一些的瓊脂上，倒薄薄一層。軟薄層瓊脂保證噬菌體擴(kuò)散，而硬厚層瓊脂為細(xì)菌提供營(yíng)養(yǎng)和支撐。
Enrichment 富集：
將含有噬菌體的樣品接種于含有其寄主細(xì)菌和生長(zhǎng)所需營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)的基質(zhì)中，以富集可以在該寄主細(xì)菌中繁殖的噬菌體。
Halo 噬菌斑暈圈：
圍繞噬菌斑中心的暈圈，渾濁程度比中心高，比細(xì)菌生長(zhǎng)部分低。
Host strain 宿主菌株：
用于繁殖特定噬菌體的細(xì)菌菌株。
Indicator strain 指示菌株：
在DLA試驗(yàn)中用于生成噬菌斑的菌株，通常也是宿主菌株（但不總是）。
Latent period 潛伏期：
細(xì)胞感染和后代噬菌體釋放之間的時(shí)間。
Lysate 裂解物：
包含子代噬菌體的液體培養(yǎng)基。通常是將噬菌體和宿主細(xì)菌細(xì)胞混合，培養(yǎng)后代噬菌體產(chǎn)生的液體培養(yǎng)基。如果噬菌體是在固體或者半固體培養(yǎng)基中生長(zhǎng)，則裂解物指的是從固體或半固體培養(yǎng)基中提取了子代噬菌體的液體緩沖液。裂解物通常需要經(jīng)過(guò)離心或過(guò)濾，去除活的細(xì)菌細(xì)胞和大的細(xì)菌碎片。
Lysogen 溶源性細(xì)菌：
具有原噬菌體/前噬菌體（prophage）的細(xì)菌。
Phage stock 噬菌體庫(kù)存：
通過(guò)噬菌斑純化等方式得到的噬菌體樣品，保證下游試驗(yàn)的穩(wěn)定性。
Plaque assay 噬菌斑測(cè)定：
是一種計(jì)數(shù)樣品中噬菌體滴度的方法，梯度稀釋噬菌體樣品，并接種于指示菌株，計(jì)數(shù)噬菌斑數(shù)量，從而計(jì)算原始樣品中噬菌體的滴度(phage titer)。
Plaque purification 噬菌斑純化：
這是獲得噬菌體純克隆樣品的過(guò)程，通過(guò)去除噬菌斑的瓊脂或者用無(wú)菌接種環(huán)接觸斑塊表面來(lái)挑選板塊。然后將該樣品直接接種到含有寄主菌株的固體培養(yǎng)基上，或者稀釋后接種在含有寄主菌株的液體培養(yǎng)基中。孵育后，從產(chǎn)生的噬菌斑上繼續(xù)重復(fù)該過(guò)程，通常至少需要三輪純化，才認(rèn)為得到了噬菌體的純克隆。
Plaque 噬菌斑：
由噬菌體在布滿細(xì)菌的平板上造成的空斑。
Prophage 原/前噬菌體：
指的是位于細(xì)菌基因組中的溫和噬菌體的基因組。在前噬菌體狀態(tài)下，多數(shù)噬菌體基因被關(guān)閉，噬菌體的基因組與宿主一起復(fù)制。當(dāng)受到誘導(dǎo)時(shí)，噬菌體變得活躍并發(fā)生病毒復(fù)制。
Soft agar 軟瓊脂：
又稱為半固體瓊脂（semisolid agar）或者頂層瓊脂（top agar）。軟瓊脂含有足夠的瓊脂來(lái)成形，但不足以形成固體層，通常為?0.2-0.7%?的瓊脂。軟瓊脂允許噬菌體擴(kuò)散，同時(shí)最大限度地減少細(xì)菌運(yùn)動(dòng)，因此用于噬菌斑的形成。
Superinfection immunity 超感染免疫：
被感染形成的溶源性細(xì)菌，由于細(xì)胞內(nèi)具有原噬菌體，故不能被第一次感染的同種噬菌體或密切相關(guān)噬菌體的再感染。也就是說(shuō)，溶源性細(xì)菌具有了抗御同種噬菌體的能力，這種現(xiàn)象稱為超感染免疫。
Temperate phage 溫和噬菌體：
一種可以以前噬菌體狀態(tài)存在的噬菌體，這類噬菌體感染宿主菌后不立即增殖，而是將其核酸整合（Integration）到宿主菌染色體中，隨宿主核酸的復(fù)制而復(fù)制，并隨細(xì)胞的分裂而傳代，這類噬菌體被稱作溫和噬菌體（temperate phage）或溶原性噬菌體（lysogenic phage）。
Virulent phage 烈性噬菌體：
該噬菌體感染細(xì)菌后，產(chǎn)生后代并使細(xì)菌細(xì)胞裂解，沒(méi)有前噬菌體狀態(tài)。
