PD-1（程序性死亡分子1），有PDCD1基因編碼，是一種重要的免疫抑制分子。之前我們對(duì)HPA數(shù)據(jù)庫進(jìn)行的簡(jiǎn)介，這里我們將利用HPA數(shù)據(jù)庫示例，搜索血液中不同免疫細(xì)胞PD1基因表達(dá)情況。

進(jìn)入HPA數(shù)據(jù)庫，搜索檢索詞：PDCD1，在結(jié)果檢索界面選擇“Blood”。在該界面上，我們可以看到PDCD1的一般信息，以及人類蛋白表達(dá)圖譜信息。我們發(fā)現(xiàn)PDCD1預(yù)測(cè)的部分主要為細(xì)胞內(nèi)和細(xì)胞膜，在蛋白譜里可以看到該基因在哪個(gè)細(xì)胞系上富集。

繼續(xù)下拉，我們可以看到在三個(gè)數(shù)據(jù)庫中相關(guān)信息，分別是Consenses?dataset，Monaco scaled dataset和Schmiedel dataset。我們可以看到Consenses?dataset中描述了PDCD1在19種細(xì)胞中表達(dá)情況，Monaco scaled dataset分類更細(xì)致，有30種，其中免疫細(xì)胞分了更過的亞群，最后在Schmiedel dataset中，只描述了在血液免疫細(xì)胞中表達(dá)情況。

Consenses?dataset：PDCD1主要在T細(xì)胞上表達(dá)，表達(dá)最高的是記憶CD8T細(xì)胞，其次記憶CD4T細(xì)胞，在GdT ,調(diào)節(jié)T，MAIT?T也有一定程度表達(dá)，在Naive CD4和Navie CD8?表達(dá)很低，其余細(xì)胞幾乎不表達(dá)。

Monaco scaled dataset：同樣顯示PDCD1主要集中在T細(xì)胞上，其中Effector記憶CD8T表達(dá)最高，具體我們可以通過點(diǎn)擊Expression去看表達(dá)順序。

Schmiedel dataset：顯示PDCD1在T細(xì)胞表達(dá)比較高，但是區(qū)別前面兩個(gè)數(shù)據(jù)庫結(jié)果，這里表達(dá)最高的是記憶CD4T，因?yàn)槲覀儼l(fā)現(xiàn)細(xì)胞類別中沒有記憶CD8T，因此我們了解到不同數(shù)據(jù)庫選擇細(xì)胞類型是有區(qū)分，我們根據(jù)我們具體需求選擇相應(yīng)數(shù)據(jù)。

另外我們可以通過圖譜右上側(cè)的Lineage,Expression和Alphabetical選擇排序方式。

今天示例就簡(jiǎn)單介紹這里了，下次再見。