2020-08-17ensemble數(shù)據(jù)庫學習

數(shù)據(jù)庫命名規(guī)則[http://www.biotrainee.com/thread-411-1-3.html]

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可以看到這個基因由于可變剪接形成了2個轉(zhuǎn)錄本,可以看到他們的名字,ID,序列長度,以及編碼的蛋白質(zhì)的氨基酸的個數(shù),

并且可以鏈接到該數(shù)據(jù)庫中去。最后一列是5種轉(zhuǎn)錄本在NCBI的Refseq數(shù)據(jù)庫中中的ID號。Refseq是一個去掉冗余的數(shù)據(jù)庫,它為基因組注釋提供了參考。對于它的ID號來說,基因組DNA以NC_####這種格式。轉(zhuǎn)錄組中如果是mRNA,則是NM_####這種格式,如果是非編碼RNA,則是NR_####這種格式。如果是蛋白的話,是以NP_####為模板的這種形式。所以在最后一列,可以看到有5個NM_開頭的,這是他的5個轉(zhuǎn)錄本,最后一個是NP_開頭的,這對應于每一個轉(zhuǎn)錄本翻譯出來的蛋白質(zhì)。

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