MEGAN6安裝及使用的問題

最近接手了一個宏基因組項目,做了一段時間,已構(gòu)建群體的基因豐度集,其間遇到的種種問題暫且不表。本以為接著就可以進行結(jié)構(gòu)和功能注釋,忙活了半個月終于可以有可視化的結(jié)果了。

結(jié)果,還是太天真,敗在Megan這個可愛的程序上。此刻寫這篇文章,想跟大家探討交流,也希望自己可以借此冷靜。

問題:

  1. 軟件linux版本不支持命令行模式
    是的,作為一個linux下的軟件,它不支持command line mode。能體會一個新手小白好容易安裝完然后 -h -v 不管 - 什么都沒反應的絕望嗎?
  2. 高階版本要付費
    高階付費版本支持命令行,官網(wǎng)有30天的試用模式,重點來了,點擊申請 trial license頁面就404。我覺得不是墻的問題。
  3. win版超級卡頓
    試了兩臺8g電腦卡的死死的,偷偷借了隔壁80g運行內(nèi)存的Windows工作站,運行2.5小時后卡的一動不動,嚇壞我了怕被抓現(xiàn)形==遂放棄
  4. 舊版本不能運行
    我想我需要用的功能很初級,megan5應該也可以,然后本地下載-安裝-運行,至今都沒出來頁面。
    這個軟件的使用說明及其難找,論壇資源也很有限,總之就是困難重重,如果Meta分析發(fā)展的像Chipseq和RNAseq那樣,該多好。

I'm a northern girl, tall and strong with really bad temper. If I'm not lazy, I will definitely beat the author right on his face.

好了,果然梳理完了之后,恢復了冷靜,決定刷幾篇文獻cheer up一下。想到解決辦法我會來分享。如果你剛好用過megan,求指教!

5.8 問題解決了:
安裝megan6時最后一步有一個選項:max memorize,默認2g可根據(jù)個人電腦性能調(diào)整,我設成了6g即6000megabase,運行幾小時后成功。
一開始安裝的時候看到 check updates之類的都默認跳過了,所以造成了失誤??磥磉€是要細心,而且不放棄不抱怨,出了問題多從自己身上找原因,哪怕是認為最不可能出錯的那一步,往往是解決問題的根源。

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