western blot試驗(yàn)中遇到的問題,希望能幫到正在苦惱的你~

寫在前面:western?blot,這個(gè)不做個(gè)十次八次,基本出不來好看條帶的實(shí)驗(yàn),相信讓很多小伙伴都感到頭禿。不過只要持之以恒,善于總結(jié),問題不大,隨著實(shí)驗(yàn)次數(shù)的增多,會(huì)持續(xù)更新內(nèi)容,個(gè)人見解存在一定局限性,歡迎一起交流哈~

比不上高分雜志嘿嘿,但對(duì)于只做了六七次的我,算是最高水平了

做膠?

Q.?注意事項(xiàng)

配緩沖液過程中,過硫酸銨最后加,防止出現(xiàn)過多氣泡。

溫度:溫度越高凝固越快,膠通常在0.5-1h內(nèi)凝固最好。充分凝固后可保鮮膜包裹4℃過夜,第二天使用。

Q.?如何判斷樣品總蛋白的提取是否成功?

跑膠前:蛋白濃度檢測,濃度低可能是提取不成功。

轉(zhuǎn)膜后:麗春紅染色,正常的話可以看到很多蛋白條帶。

顯色后:內(nèi)參及目的蛋白的檢測。

上樣

Q.?上樣時(shí)有的樣品沉淀,有的清亮?

1.考慮沒有完全變性,適當(dāng)提高SDS濃度,同時(shí)延長煮沸時(shí)間。

2.考慮蛋白濃度過高,加入緩沖液稀釋。

電泳

Q. 影響電泳結(jié)果的因素

1.?電壓:低電壓下篩選效應(yīng)充分,條帶漂亮。

2. 膠的均勻度:膠越均勻,條帶越窄,分離越均勻。

Q.?條帶形狀

︶笑臉型:凝結(jié)冷卻不均勻,中間冷卻不好。

︵皺眉狀:可能凝膠和玻璃板底部有氣泡。

拖尾:樣品溶解不好

縱向條紋:樣品中有不溶性顆粒

條帶偏斜:電極不平衡或者加樣位置偏斜

條帶兩邊擴(kuò)散:加樣量過多溢出

Q.?大分子量蛋白轉(zhuǎn)移效率低?

轉(zhuǎn)移緩沖液加SDS(終濃度0.1%);提高轉(zhuǎn)移電壓/電流;增加轉(zhuǎn)移時(shí)間

Q.?小分子量蛋白轉(zhuǎn)移需注意?

使用0.22um 或0.1um 的NC膜;減少轉(zhuǎn)移時(shí)間,30min足夠。

轉(zhuǎn)膜

我們用的是濕轉(zhuǎn)法,效率比較高,如果目的蛋白很小,可以考慮半干轉(zhuǎn)。

Q.?過轉(zhuǎn)和轉(zhuǎn)膜不充分?

對(duì)于大分子量(>100kd)蛋白而言,一般不用考慮過轉(zhuǎn)情況,看條帶對(duì)應(yīng)的marker是否轉(zhuǎn)上,即可確定自己的條帶是否轉(zhuǎn)上。如果沒有,適當(dāng)增加電壓/電流,延長時(shí)間,還有避免膠和膜中間有氣泡。

小分子量(<15kd)尤蛋白容易出現(xiàn)過轉(zhuǎn),同樣麗春紅染膜或觀察marker即可確認(rèn)有沒有過轉(zhuǎn)。

Q.?PVDF的預(yù)處理?

PVDF膜先置于甲醇中處理10 s,然后浸于電轉(zhuǎn)緩沖液中10 min,再夾三明治。NC膜則不需要預(yù)處理。

封閉

我們用的是5%脫脂奶粉,10%TBS緩沖液配制。

Q.?封閉時(shí)間

正常情況,室溫封閉1h即可。如果曝光背景過高,可以適當(dāng)延長封閉時(shí)間至2-5h,也可以4℃過夜,封閉時(shí)間過長并不會(huì)導(dǎo)致檢測信號(hào)減弱

如果延長了封閉時(shí)間,背景還是高??紤]抗體濃度過高,可稀釋使用;目的蛋白豐度太低,信號(hào)弱。

Q. 封閉液有雜質(zhì)顆粒?

(靜置牛奶使大顆粒沉淀,僅用上層)

牛奶里面會(huì)有一些不懸浮的大顆粒,對(duì)封閉無益??梢栽谵D(zhuǎn)膜開始之后配好牛奶,在充分?jǐn)嚢韬玫那疤嵯拢o置于4℃。使用時(shí)不要擔(dān)心牛奶不均而特意混勻,只吸上層部分完全ok。

孵抗體

Q.?如何提高磷酸化抗體的檢測質(zhì)量?

提高蛋白上樣量;適當(dāng)增加封閉時(shí)間,延長一抗孵育時(shí)間;封閉的選擇:5%脫脂奶粉? 5%BSA?;磷酸酶抑制劑;樣本低溫操作,最好是新鮮樣品,反復(fù)凍融易降解。

顯影

Q.?目的條帶很弱?

加大上樣量,調(diào)整抗體比例,轉(zhuǎn)膜效率。

Q.?背景太深?

降低抗體比例;封閉液中加去垢劑:吐溫20;降低上樣量;用其他蛋白做封閉液:5%BSA,serum;

Q.?條帶有時(shí)清晰,有時(shí)彌散?

樣品可能存在降解;轉(zhuǎn)膜不及時(shí)造成擴(kuò)散。


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