本文選自Molecular Therapy: Nucleic Acids,https://doi.org/10.1016/j.omtn.2019.12.028,喜歡的朋友可以拿去。別廢話(huà),上圖啊!
對(duì)不起,真沒(méi)有流程圖(沒(méi)有圖你也能發(fā)文章)。如果不介意,我可以手繪一個(gè)。

作者用的GEO數(shù)據(jù)挖掘,發(fā)現(xiàn)本文circRNA在胰腺癌高表達(dá),然后,在 Circular RNA Interactome website https://circinteractome.nia.nih.gov/miRNA_Target_Sites/mirna_target_sites.html預(yù)測(cè)了結(jié)合的miRNA? miR-324-5p,miR-377, and miR-486-3p.然后又在StarBase預(yù)測(cè)了miR-377的靶點(diǎn),又和GEO的三個(gè)數(shù)據(jù)集取了一個(gè)交集,發(fā)現(xiàn)了miRNA的兩個(gè)靶點(diǎn):CAMK2N1 and HOXC6,在PDAC中高表達(dá)。

接著作者又在組織中驗(yàn)證了一下circRNA表達(dá)情況,和數(shù)據(jù)庫(kù)的一致,然后分析了和生存相關(guān),以及細(xì)胞系表達(dá)情況(這不是套路嗎)

然后作者又了功能驗(yàn)證,也就是活力,細(xì)胞周期,增殖之類(lèi)的,然后敲減和過(guò)表達(dá),體內(nèi)實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證促進(jìn)腫瘤和抑制腫瘤生長(zhǎng)的情況。


然后驗(yàn)證靶點(diǎn),先FISH定位聚集在哪。一般聚集在細(xì)胞質(zhì),就在細(xì)胞質(zhì)中發(fā)揮作用,聚集在核內(nèi)那就厲害了。然后就要驗(yàn)證這個(gè)miR存在了,然后再找他們互補(bǔ)結(jié)合的部位,然后熒光素酶報(bào)告他們結(jié)合在一起,PULL down再拉下來(lái)。進(jìn)一步驗(yàn)證了miRNA的靶點(diǎn)。

TCGA分析一波,發(fā)現(xiàn)miRNA低表達(dá),然后就是一波對(duì)于miRNA的操作,和circRNA一樣的。

最后就是那個(gè)蛋白了,驗(yàn)證一波,然后又是對(duì)蛋白的一波操作。


至此,本文結(jié)束了。還是屬于一般的套路的文章,機(jī)制也不是特別深,對(duì)于他們這個(gè)分組我還是覺(jué)得挺有意思的??赡芫褪巧藕蜋C(jī)制相結(jié)合相互驗(yàn)證的文章,其實(shí)并沒(méi)有特別的創(chuàng)新點(diǎn)。謝謝大家,歡迎批評(píng)、指正。