一、介紹
1.BioCyc
BioCyc是代謝途徑的數(shù)據(jù)庫(kù)集合，集合中的每個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)描述了單個(gè)生物體的基因組和代謝途徑（MetaCyc是來自代謝途徑的參考來源），包括反應(yīng)、酶、基因和底物化合物。第一層數(shù)據(jù)庫(kù)包含EcoCyc、MetaCyc和BOCD，第二層和第三層數(shù)據(jù)庫(kù)則包含了計(jì)算預(yù)測(cè)代謝通路，以及哪些基因編碼代謝通路中缺少酶的預(yù)測(cè)和預(yù)測(cè)的操縱子。BioCyc提供的分析工具包括：基因組瀏覽器、個(gè)體代謝通路和完整代謝圖的顯示等。
【https://humancyc.org/publications.shtml#】
【http://metacyc.ai.sri.com/PToolsWebsiteHowto.shtml#SearchHelp】
2.MetaCyc
MetaCyc數(shù)據(jù)來源科學(xué)實(shí)驗(yàn)文獻(xiàn)，為代謝通路和酶提供了大量的參考信息，含有初生代謝和次生代謝通路，還包括相關(guān)的化合物、酶和基因。Metacyc是一個(gè)多有機(jī)體數(shù)據(jù)庫(kù)，其他生物數(shù)據(jù)庫(kù)描述單個(gè)生物體的代謝網(wǎng)絡(luò)和基因組，并將實(shí)驗(yàn)確定的路徑與計(jì)算預(yù)測(cè)的路徑混合。Metacyc僅包含實(shí)驗(yàn)闡明的途徑。
MetaCyc的應(yīng)用：查詢代謝通路、預(yù)測(cè)基因組測(cè)序中的代謝通路、通過酶數(shù)據(jù)庫(kù)支持代謝通路。
二、使用
參考：
1.國(guó)基還未中？你與國(guó)基之間可能就差這么幾個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)！！
