WGCNA包的blockwiseModules函數(shù)debug

WGCNA debug

net = blockwiseModules(datExpr, power = sft$powerEstimate,
maxBlockSize = 6000,TOMType = "unsigned", 
minModuleSize = 30,reassignThreshold = 0, mergeCutHeight = 0.25,
numericLabels = TRUE, pamRespectsDendro = FALSE,
saveTOMs = TRUE,
saveTOMFileBase = "AS-green-FPKM-TOM",
verbose = 3)

運(yùn)行到這里報(bào)錯(cuò):
Error in (new("standardGeneric", .Data = function (x, y = NULL, use = "everything", :
unused arguments (weights.x = NULL, weights.y = NULL, cosine = FALSE)

已解決,這里面涉及超多問題,發(fā)現(xiàn)很多人都遇到這個(gè),是WGCNA包與其他函數(shù)沖突導(dǎo)致的;
輸入

cor <- WGCNA::cor

暫時(shí)分配功能
再運(yùn)行
blockwiseModules
后面再調(diào)回來

cor<-stats::cor

天天都在和bug作斗爭(zhēng),浪費(fèi)時(shí)間啊哎

?著作權(quán)歸作者所有,轉(zhuǎn)載或內(nèi)容合作請(qǐng)聯(lián)系作者
【社區(qū)內(nèi)容提示】社區(qū)部分內(nèi)容疑似由AI輔助生成,瀏覽時(shí)請(qǐng)結(jié)合常識(shí)與多方信息審慎甄別。
平臺(tái)聲明:文章內(nèi)容(如有圖片或視頻亦包括在內(nèi))由作者上傳并發(fā)布,文章內(nèi)容僅代表作者本人觀點(diǎn),簡(jiǎn)書系信息發(fā)布平臺(tái),僅提供信息存儲(chǔ)服務(wù)。

相關(guān)閱讀更多精彩內(nèi)容

友情鏈接更多精彩內(nèi)容