真菌菌絲中總RNA的提取----TRNzol Universal總RNA提取試劑

原理概述:
RNA是一類極易降解的分子,要得到完整的RNA必須最大限度地抑制提取過程中內(nèi)源性及外源性核糖核酸酶對RNA的降解。高濃度強(qiáng)變性劑異硫氰酸胍,可溶解蛋白質(zhì),破壞細(xì)胞結(jié)構(gòu),使核蛋白與核酸分離,滅活RNA酶,所以RNA從細(xì)胞中釋放出來時不被降解。細(xì)胞裂解后,除了RNA,還有DNA、蛋白質(zhì)和細(xì)胞碎片,可通過酚、氯仿等有機(jī)溶劑處理得到純化、完整的總RNA。
真核細(xì)胞中含有多種RNA,如rRNA、mRNA、tRNA及一些小分子RNA。RNA以rRNA的數(shù)量最多,占80%-85%,tRNA及核內(nèi)小分子 RNA10%-15%,而mRNA分子占1%-5%。


核酸提取原則:
⑴ 保證核酸的完整性;
⑵ 獲得高純度的核酸;
⑶ 操作簡便,穩(wěn)定性強(qiáng)。


圖片來自TIANGEN-mRNA.png
一、利用TRNzol Universal總RNA提取試劑

TRNzol Universal 是在TRNzol 基礎(chǔ)上研發(fā)的含有指示劑的總RNA 提取試劑。該產(chǎn)品具有更強(qiáng)的裂解能力,更高的靈敏度,可從病毒、細(xì)菌、真菌、動物和植物細(xì)胞、組織、體液等樣本中提取總RNA 的試劑。TRNzol Universal 能夠充分裂解樣本、溶解細(xì)胞內(nèi)含物,并有效抑制RNase 活性,提取樣本中的總RNA,同時保證了提取過程中RNA 的完整性。該試劑對樣本起始量無限制,一個小時內(nèi)即可完成反應(yīng)。

TRNzol Universal試劑.jpg
  1. 自備試劑
    氯仿、異丙醇、無菌水、75%乙醇(用無菌水配制)

  2. Prepare
    1.5ml離心管、計(jì)時器、液氮、研缽、鑷子、渦旋振蕩器、低溫離心機(jī)、超微量分光光度計(jì)

  3. 注意事項(xiàng):


    圖片來自TIANGEN官網(wǎng).png

  4. Steps


⑴ 取0.1g新鮮菌絲于液氮中快速研磨成粉末,轉(zhuǎn)入1.5mL滅菌冷凍離心管中;
⑵ 渦旋混勻,室溫靜置5min;
⑶ 加入200μl氯仿,劇烈振蕩15sec,室溫放置3min;
⑷ 4℃ 12,000rpm離心15 min。樣品會分成三層:粉色的有機(jī)相,中間層和上層無色的水相,RNA主要在水相中,把水相約500 μl轉(zhuǎn)移至新的1.5mL離心管中;


離心后出現(xiàn)分層.jpg

⑸ 在得到的水相溶液中加入等體積異丙醇,混勻,室溫放置10 min;
⑹ 4℃ 12,000 rpm離心10 min,去上清。離心前RNA沉淀經(jīng)常是看不見的,離心后在管側(cè)和管底形成膠狀沉淀;
⑺ 加入1 ml 75%乙醇洗滌沉淀;
⑻ 4℃ 10,000 rpm 離心2min,倒出液體,剩余的少量液體短暫離心,然后用槍頭吸出;
⑼ 室溫放置3min晾干沉淀;
⑽ 加入30-50μl RNase-Free ddH2O,反復(fù)吹打、混勻,充分溶解RNA(冰上進(jìn)行)。


Min point :
異硫氰酸胍裂解細(xì)胞,使得RNase失活;同時使得核酸蛋白復(fù)合物分離,將RNA釋放到溶液中;
酸性酚-氯仿抽提,低pH值的酚使RNA進(jìn)入水相,蛋白和DNA留在有機(jī)相
苯酚和脂類溶于有機(jī)溶劑氯仿中形成有機(jī)相;由于氯仿密度較大,使得有機(jī)相位于下層,而水相在上層
異丙醇:沉淀RNA
乙醇:沉淀RNA、除小分子、清除多余的有機(jī)溶劑
測定OD260/280=1.9~2.1

圖片來自TIANGEN官網(wǎng).png

RNA溶于上層的水相.png

Total RNA.png
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