如何從KEGG上下載信息

我想有些小伙伴會面臨這個問題,我從KEGG上搜索到了信息,怎么下載呢?

這里小編介紹一個小技巧,如何從KEGG上下載數(shù)據(jù)。

KEGG網(wǎng)址:https://www.kegg.jp/

其實我們可以利用一個網(wǎng)址來下載數(shù)據(jù),在此用GNAS基因作為示例,其他的基因或通路也可采取同樣的方式。

1,你需要事先查詢基因/通路的KEGG ID,GNAS的ID是KO4632

https://www.kegg.jp/dbget-bin/www_bget?ko:K04632

image.png

2, KEGG API: https://www.kegg.jp/kegg/rest/keggapi.html

image.png

你可以打開這個網(wǎng)址 http://rest.kegg.jp/get/K04632

如果是其他的KEGG ID, 則是 http://rest.kegg.jp/get/****

image.png

https://www.kegg.jp/kegg/rest/keggapi.html
3. 你可以在Linux環(huán)境下用wget下載,或者在window環(huán)境下右鍵另存為一個文件。

到此你就把所需信息下載下來啦!

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