NCBI（National Center for Biotechnology Information）https://www.ncbi.nlm.nih.gov/

NCBI官方介紹是：

NCBI advances science and health by providing access to biochemical and genomic information.

對做系統發(fā)育的我們來說就是上傳、下載以及分析自己分子數據的地方。

這里說下載數據

我們下載一般的核苷酸數據，在搜索框左面的All Databases中選擇Nucleotide，然后在搜索框內編輯要查找的。

比如我們要下載禾本科的葉綠體基因組數據，我們可以輸入：Poaceae chloroplat complete genome，點擊Search之后，出來的結果可能并不都是葉綠體數據，我們在出現在左邊的項目欄里點擊特定的選項，這里我們點擊Genetic compartments 下面的Chloroplast，網站會自動篩選出葉綠體數據。

我們隨便點進去一個，就會出現下面的頁面：

我們看到在確切信息Paspalum ionanthum chloroplast, complete genome下面有一個：

GeneBank：MG524002.1

這里的MG524002.1是這條基因序列在GeneBank中的編號（accession number）。GeneBank，顧名思義，就像一個基因銀行，但和真正的銀行不同的是，基因銀行存儲的基因序列是所有人共享的，可以自由上傳和下載。上傳的人可以更改這條序列的相關信息，但是編號是不變的。

那我們如何下載這條序列呢？

點擊Send to右邊的倒三角，按圖中給出的提示選擇，Format（格式）建議選擇GenBank，然后點擊Create File，就可以進行下載。

當我們下載多條序列時，我們也可以在上一個界面中，點擊要下載的item（序列項目）前面的方括號，然后點擊右上角Send to，同上面單條序列一樣。

當我們有大量的序列需要下載（已經有這些序列的序列號accession number了），我們可以進行批量下載。

批量下載有兩種辦法：

NCBI有官方的途徑：Batch Entrezhttps://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/batchentrez

操作比較簡單，首先我們準備一個含有accession number的.txt格式的文件，

然后在Batch Entrez界面上面的工具欄中，Database選擇相對應的數據庫，File選擇我們準備好的.txt文件，然后點擊Retrieve（檢索），出現下面的頁面，

點擊最下面一行Retrieve records for...，然后進入這個頁面，

不用選擇items前面的方塊，直接點擊右上Send to，同之前的操作一樣。

另外推薦一個好用的軟件TBtools（批量下載只是TBtools其中很小的一個功能）：

下載網址：https://github.com/CJ-Chen/TBtools-Manual

點擊上圖中綠色方框Clone?or?download，然后選擇Download Zip

可以安裝在windows系統，安裝好打開，按圖中的提示點擊，

出現下面的界面以后，既可以在空白區(qū)域直接粘貼編號，也可以點擊空白區(qū)右邊的藍色長方形上傳包含編號的文件，在下面的Set Output File設置文件下載的路徑。