差異分析，老生常談的問(wèn)題，代碼網(wǎng)上一搜都是一堆，但是真正難的地方在于如何準(zhǔn)備數(shù)據(jù)集，我要怎么做，才是最優(yōu)解呢？

https://www.ezygene.com/tool/differential_analysis_visualization

內(nèi)嵌數(shù)據(jù)庫(kù)，可自由選擇合適的數(shù)據(jù)集，當(dāng)然也支持自己上傳表達(dá)矩陣

在分析的時(shí)候需要注意的是分組文件如何獲取

轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)預(yù)處理-導(dǎo)出樣本信息

將該樣本的信息導(dǎo)出，自己設(shè)置分組即可

如這里選擇GSE31210的數(shù)據(jù)集，先獲取樣本信息，在設(shè)置分組

整理成如下的格式

這里的分組我寫(xiě)的A和B

提交后，等待運(yùn)行成功就可以了

簡(jiǎn)單的爆炸，當(dāng)然，你也可以使用上傳數(shù)據(jù)的形式進(jìn)行，只需要自己準(zhǔn)備一個(gè)表達(dá)譜矩陣即可，分組文件一樣的設(shè)置。

接下來(lái)就是差異分析的可視化了，直接選擇第二步

火山圖,參數(shù)可以按照需求自己更改

logfc排序散點(diǎn)圖

根據(jù)差異分析的結(jié)果制作一個(gè)基因分組的表格

差異基因表達(dá)的熱圖

差異基因表達(dá)的熱圖

隨機(jī)選的數(shù)據(jù)，圖不是很好看