Python | 統(tǒng)計(jì)FAST文件里多個(gè)基因的長(zhǎng)度


假如以下這個(gè)腳本為Gene_length.py, 測(cè)試的fasta文件為test.fasta,輸出文件為outfile

代碼的運(yùn)行命令(在linux中):python Gene_length.py test.fasta outfile

* 其中 ID = re.split(r'\.',line)[2] 這一步是因?yàn)樵糵asta文件里ID名稱是這樣的>evm.model.Contig62652.1.我們需要的是Contig62652這一部分,這個(gè)ID是用.來(lái)分割,而我們需要的是第三部分,在列表中是屬于【2】

代碼實(shí)例
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