知識整理|《生物化學與分子生物學》第一章:蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)與功能

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蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)與功能

01

蛋白質(zhì)的分子組成

蛋白質(zhì)的組成元素

碳(50%- 55%)氫(6%-7%)氮(13%-19%)

硫(0%-4%)? 和少量磷或金屬后素

計算蛋白質(zhì)大致含量:

每克樣品含氮克數(shù)x 6.25X100 = 100g樣品中蛋白質(zhì)含量(g%)

1.組成人體蛋白質(zhì)的20種L-α-氨基酸

連在一C00基上的碳原子為α-碳原子,為不對稱碳原子(甘氨酸除外)

非極性臘肪族氨基酸:

甘氨酸(Gly)? 丙氨酸(Ala)? 纈氨酸( Val)

亮氨酸(Leu )異亮氨酸( Ile)脯氨酸(Pro)

極性中性氨其酸:

絲氨酸(Ser)? 半胱氨酸 (Cys)甲硫氨酸(Met)

天冬酰胺(Asn)谷氨酰胺(Gln)蘇氨酸(Thr)

含芳香環(huán)的氨基酸:

苯丙氨酸 (Phe) 酪氨酸(Tyr )色氨酸(Trp)?

酸性氨基酸:

天冬氨酸(Asp) 谷氨酸(Glu)

堿性氨基酸:

賴氨酸(lys)? ? ? 組氨酸(His)? ? ? 精氨酸(Arg)

2.氨基酸的理化性質(zhì)

氨基酸具有兩性解離的性質(zhì):

等電點:在某一PH的溶液中,氨基酸解離成陽離子和陰離子的趨勢及程度相等,呈電中性,此時溶液的PH稱為該氨基酸的等電點PI=(Pk1+Pk2)

含其軛雙鍵的氨基酸具有緊外線吸收性質(zhì)

含共軛雙鍵的色氨酸,酪氨酸的最大吸收峰在280nm波長附近。

3.體內(nèi)存在的種重要的生物話性肽

谷胱甘肽( GSH) 含有巰基,且具有還原性,

多肽類激素及神經(jīng)肽

02

蛋白質(zhì)的分子結(jié)構(gòu)

1.一級結(jié)構(gòu)

一級結(jié)構(gòu)是蛋白質(zhì)分子中從N-端到C-端的氨基酸排列

順序。

化學鍵: 肽鍵。二流鍵

注:一級結(jié)構(gòu)是蛋白質(zhì)空間構(gòu)象和特異生物學功能的基礎,但不是決定蛋白質(zhì)空間構(gòu)象的唯一因素。

2.二級結(jié)構(gòu)

二級結(jié)構(gòu)是指強白質(zhì)分子中某一段膚鏈的局部空間結(jié)構(gòu),

也就是該段肽鏈主鏈骨架原子的相對空間位置,并不涉及氨基酸殘基側(cè)鏈的構(gòu)象。

二級結(jié)構(gòu)包括:

α-螺旋,走向為順時針,螺距0.54nm,每3.6個氨基

酸上升一圈

肽鍵中的羰氧和氨基氫可形成復鍵,以穩(wěn)固結(jié)構(gòu)

β-折疊,每個肽單元以以Cα為旋轉(zhuǎn)點,依次折疊成鋸齒結(jié)構(gòu)殘基側(cè)鏈交替地位于鋸齒狀結(jié)構(gòu)的上下方

β-轉(zhuǎn)角和無規(guī)卷曲在蛋白質(zhì)中普遍存在。

肽單元:參與肽鍵的6個原子, Cα1,C, O,N, H, Cα2位于同一平面,Cα1 和Cα2 在平面上所處的位置為反式構(gòu)型,此同一平面上的6個原子構(gòu)成了所謂的肽單元。

超二級結(jié)構(gòu):由2個或2個以上具有二級結(jié)構(gòu)的肽鏈在空

間上相互接近形成一個有規(guī)則的二級結(jié)構(gòu)。

3.三級結(jié)構(gòu)

三級結(jié)構(gòu)是指整條肽鏈中全部氨基酸殘基的相對空

間位置,就是整條肽鏈的所有原子在三維空間的排布位置。

化學鍵: 疏水鍵,鹽鍵,氫鍵和范德華力。

結(jié)構(gòu)域:分子量破大的量年并可以析宣成的個話構(gòu)較為最應且程定的正域并各任其功像

分子伴侶:一類在細胞內(nèi)幫助新生肽鏈正確組裝成為成熟的蛋白質(zhì)或阻止其錯誤折疊作用后,便從靶蛋白質(zhì)上脫離下來的一類蛋白質(zhì),它不是靶蛋白質(zhì)的組成部分。

結(jié)構(gòu)域:分子量較大的蛋白質(zhì)可以折疊成較為緊密且穩(wěn)定的區(qū)域,并各行其功能。

4.四級結(jié)構(gòu)

四級結(jié)構(gòu)是蛋白質(zhì)分子中各個亞基的空間排布及亞基接觸

部位的布局和相互作用。

化學鍵: 氫建、離子建

03

蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能關系

一級結(jié)構(gòu)是空間構(gòu)象的基礎

分子?。旱鞍踪|(zhì)分子發(fā)生變異所導致的疾病,被稱為“分子病”,其病因為基因突變所致。

蛋白質(zhì)構(gòu)象?。旱鞍踪|(zhì)構(gòu)象發(fā)生變化引起的疾病

例:人紋狀體脊骨髓變性病,阿爾茨海默癥,亨廷頓舞蹈病協(xié)同效應:是指一個亞基與其配體結(jié)合后,能影響此寡聚體中另一亞基與配體的結(jié)合能力。如果是促進作用則為正協(xié)同作用,反之則為負協(xié)同作用。

04

蛋白質(zhì)的理化性質(zhì)及其分類

蛋白質(zhì)具有兩性電離性質(zhì)

等電點:在某一PH的溶液中,蛋白質(zhì)解離成陽離子和陰離子的趨勢及程度相等,呈電中性,此時溶液的PH稱為該蛋白質(zhì)的等電點。

大多數(shù)的蛋白質(zhì)多數(shù)接近于pH=5.0

蛋白質(zhì)具有膠體性質(zhì)

蛋白質(zhì)屬于大分子,分子量可自1萬至100萬之巨,其分子的直徑可達1-100nm,為膠粒范圍之內(nèi)。

水化膜和表面電荷是蛋白質(zhì)膠體顆粒的兩個穩(wěn)定因素。

蛋白質(zhì)空間結(jié)構(gòu)破壞而引起變性

蛋白質(zhì)變性:在某些物理和化學因素下蛋白質(zhì)的空間構(gòu)象被破壞,使有序的空間變?yōu)闊o序的空間結(jié)構(gòu),從而導致其理化性質(zhì)發(fā)生改變和生物活性的喪失。

蛋白質(zhì)復性:若蛋白質(zhì)變性程度較輕,去除變性因素后,有些蛋白質(zhì)仍可恢復或部分恢復其原有的構(gòu)想和功能。

蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)的比較常用來預測量白質(zhì)之間結(jié)構(gòu)與功能的相似性

蛋白質(zhì)的分類:?

按組成成份:單純蛋白質(zhì)、結(jié)合蛋白質(zhì)。

按形狀分為:纖維蛋白質(zhì)、球狀蛋白質(zhì)。

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