【R語言 第2篇】K-means聚類分析流程

聚類算法是沒用因變量的。
聚類算法有層次聚類、基于劃分的聚類、兩步聚類法、基于密度的聚類。

聚類方法的邏輯

客戶細(xì)分是將全體客戶劃分為多個(gè)分組并刻畫特征的過程,使得組內(nèi)客戶高度相似,組間客戶差異明顯。
基本邏輯:
步驟1:從N個(gè)觀測(cè)和K各屬性數(shù)據(jù)開始;
步驟2:計(jì)算N各觀測(cè)兩者之間的距離;
步驟3:將相離最近的觀測(cè)聚為一類,距離遠(yuǎn)的分為不同類。最終達(dá)到組間的距離最大化,組間的距離最大化。

特別注意:

聚類分析前要對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化(scale),然后做主成分分析(降維)。

K-means聚類示例

  • 得知當(dāng)前文件位置
    getwd()
  • 更改文件位置
    setwd("E:/R/……")
  • 這里使用河流化學(xué)成份對(duì)有害藻類影響的數(shù)據(jù)集
  • 數(shù)據(jù)屬性說明:
  • season 季節(jié)
  • size 河流大小
  • speed 河流速度
  • mxPH 最大PH值
  • mnO2 最小含氧量
  • Cl 平均氯化物含量
  • NO3 平均硝酸鹽含量
  • NH4 平均氨含量
  • oPO4 平均正磷酸鹽含量
  • PO4 平均磷酸鹽含量
  • Chla 平均葉綠素含量
  • algae 有害藻的頻率數(shù)目
  • 讀入數(shù)據(jù)
    vdata=read.csv("algpre.csv")
  • 加載包,查看數(shù)據(jù)缺失情況
    library(ggplot2)
    library(dfexplore)
    dfplot(vdata)
    summary(vdata)
  • 層次聚類、基于劃分聚類(Kmeans)、基于密度聚類都只可以用于連續(xù)變量,
  • 使用mxPH,mnO2,Cl,NO3,NH4,oPO4,PO4,Chla這些屬性進(jìn)行聚類。
    Vdata2<-vdata[,c("mxPH","mnO2","Cl","NO3","NH4","oPO4","PO4","Chla")]
  • 進(jìn)行kmeans聚類前,需要進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化處理,這里使用scale函數(shù)進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化
    data1=scale(Vdata2)
  • 加載fpc包,使用pamk函數(shù),確定聚類個(gè)數(shù)
    library(fpc)
    pamk.result=pamk(data1)
    pamk.result$nc
  • 使用stats包中的kmeans函數(shù),iter.max最大迭代次數(shù),可寫可不寫,但是數(shù)據(jù)量很大的時(shí)候,一定要寫防止死機(jī)。
    kmd=kmeans(data1,centers = pamk.result$nc,iter.max = 100)
  • 輸出聚類結(jié)果
    type=kmd$cluster
  • 查看聚類結(jié)果分布
    table(type)
  • 聚類中心結(jié)果輸出
    centerver=kmd$centers
    centerver
  • 將聚類中心結(jié)果寫入本地excel中,用excel雷達(dá)圖來描述聚類因子特征,找出每類的優(yōu)勢(shì)特征和劣勢(shì)特征。
    write.csv(centerver,'E:/R/……/centerver.csv')
  • 把聚類結(jié)果添加到原始數(shù)據(jù)中
    data2<-cbind(vdata,type=kmd$cluster)

下篇將補(bǔ)上“主成分分析和因子分析”的實(shí)際操作。

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