Conda是一個(gè)非常好用的工具，既可以管理packages，也可以管理和下載軟件，還可以建立多個(gè)虛擬環(huán)境來(lái)獨(dú)立運(yùn)行多個(gè)版本的軟件。conda分為anaconda和miniconda。anaconda是包含一些常用包,miniconda是精簡(jiǎn)版。做生信常常用的一些包只支持老版本的R，一些新開(kāi)發(fā)的包又只支持最新的R，這里我們用conda建立多個(gè)版本的R環(huán)境。
conda的安裝：
下載地址：https://www.anaconda.com/distribution/
https://docs.anaconda.com/anaconda/install/
查看是否安裝conda，從終端輸入
conda --version
#或者
which conda
如果安裝了的話(huà)，會(huì)顯示現(xiàn)在所用的版本等信息，沒(méi)有的話(huà)，可以下載安裝，安裝好了別忘記配置環(huán)境變量。
# 以anaconda3為例：
echo 'export PATH="~/anaconda3/bin:$PATH"' >> ~/.bashrc
source ~/.bashrc
環(huán)境創(chuàng)建：conda create -n new_env(環(huán)境名）
環(huán)境的查看：
conda env list
如需要安裝特定版本的軟件:
conda install 軟件名=版本號(hào)
最新Python的安裝：
conda create -n py37 python=3.7
#或者
conda create --name python37 python=3.7
進(jìn)入python 3.7 環(huán)境：
conda activate py37
#或者
source activate py37
退出環(huán)境：
conda deactivate
#或者
source deactivate py37
創(chuàng)建不同版本R環(huán)境：
conda create -n r36 r=3.6
安裝特定版本R
conda install -c r r=3.6
#或
conda install r=3.6
conda來(lái)安裝R的packages
https://docs.anaconda.com/anaconda/packages/r-language-pkg-docs/
conda install -c r r-dplyr
查看已創(chuàng)建的環(huán)境：
conda info --envs
#或者
conda env list
最后不需要的環(huán)境需要移除的話(huà)：
conda remove -n py27 --all
復(fù)制一個(gè)環(huán)境：
conda create -n newenv --clone py27
查看conda安裝的包：
conda list
刪除已安裝的軟件或者包：
conda remove -n 環(huán)境名 軟件名
#卸載指定軟件:
conda remove 軟件名
更新某個(gè)軟件:
conda update 軟件名
參考：
http://m.itdecent.cn/p/edaa744ea47d
http://m.itdecent.cn/p/2f3be7781451
http://m.itdecent.cn/p/17288627b994
https://zhuanlan.zhihu.com/p/46902996
https://blog.csdn.net/ITLearnHall/article/details/81708148
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