動物線粒體基因組注釋軟件MITOS2安裝與使用

MITOS2可用于注釋后生動物以及真菌等線粒體基因組注釋，主要注釋線粒體18個核心基因（atp6 atp8 atp9 cob cox1 cox2 cox3 dpo lagli msh1 mttb nad1 nad2 nad3 nad4 nad4l nad5 nad6）

GitLab下載網(wǎng)站 MITOS GutLib，可用于linux系統(tǒng)上進(jìn)行分析，
MITOS在線分析網(wǎng)站MITOS在線分析工具，可以將多個個體的線粒體基因組序列合并一起成fasta文件提交

以下講述linux安裝使用

安裝
pip3 install mitos  -i https://mirrors.aliyun.com/pypi/simple/
下載參考基因數(shù)據(jù)庫Reference data，小編這里下載refseq63m.tar.bz2
使用
runmitos.py -i sequence.fa  -c 2 -r refseq63m --refdir /path/refdata -o output

參數(shù)可以參考在線網(wǎng)站上的參數(shù)：

-c參數(shù)是選用物種類別，2表示脊椎動物，4表示霉菌，5表示無脊椎動物
-r參考序列庫，自己下載的庫名稱
--refdir參考庫所在路徑

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