花花提示了頓號(hào)，說(shuō)明前面的不規(guī)范，改！
進(jìn)入正題，今天學(xué)習(xí)在Linux下安裝軟件
一.安裝流程
1.準(zhǔn)備工作：安裝 bzip2
yum install -y bzip2 #安裝 bzip2
2.安裝號(hào)稱(chēng)“app store"的軟件管理miniconda
- 準(zhǔn)備好miniconda 網(wǎng)址，一會(huì)放入命令里就自動(dòng)鏈接安裝
去官網(wǎng)找miniconda的下載鏈接，右鍵復(fù)制
- 登陸putty,進(jìn)入目錄biosoft下
cd biosoft
wget +鏈接 #（剛才miniconda的下載鏈接，例如 wget https://repo.continuum.io/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh）
- 運(yùn)行鏈接（發(fā)現(xiàn)代碼背景是黑色，不好看，以后就用引用段落替代吧）
bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
## （發(fā)現(xiàn)代碼背景是黑色，不好看，以后就用引用段落替代吧）
接下來(lái)是閱讀安裝許可，點(diǎn)擊鍵盤(pán)Enter就行，大概9-11次，然后看到顯示要輸入 yes/no 的時(shí)候，輸入 yes,運(yùn)行，再按enter
- 等待安裝
- 出現(xiàn)提示yes\no,輸入yes
-
安裝成功，就會(huì)顯示 thank you for installing miniconda3!9(如下圖)
安裝成功
最后關(guān)鍵一步，激活conda
source ~/.bashrc
- 加載鏡像（一行行復(fù)制，我也不知道為何不能一起復(fù)制運(yùn)行，/(ㄒoㄒ)/）
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda
conda config --set show_channel_urls yes
完美！
二.開(kāi)始玩conda啦（安裝和卸載軟件）
- 查看軟件列表
conda list
- 搜索軟件
conda search fastqc
- 安裝軟件
conda install fastqc -y
ps:花花說(shuō)，加上-y是自動(dòng)安裝。
可能就是最后安裝好了會(huì)問(wèn)你yes\no，這里加 y ,是一起運(yùn)行了yes的意思？
- 卸載軟件
conda remove fastqc -y
最后前面會(huì)多出一個(gè)（base）,不要緊，澤哥解釋如下：
因?yàn)槟惆惭b了conda，現(xiàn)在的conda默認(rèn)就會(huì)在前面加上默認(rèn)的環(huán)境名稱(chēng)，也就是base
如果你切換到其他的小環(huán)境，那么base就會(huì)改變。只是conda的一個(gè)提醒功能而已
|~~~明了哈哈
前期準(zhǔn)備工作比較多，加油
今日安裝沒(méi)有報(bào)錯(cuò)，簡(jiǎn)直太感動(dòng)了，感謝花花和前面的人的摸索，提供了經(jīng)驗(yàn)
