Matrix::readMM包報Dim_validate錯誤

在使用Matrix::readMM讀取10x的mtx文件的時候，出現(xiàn)一下報錯：

a=Matrix::readMM('matrix.mtx')
Error in isTRUE(r <- .Call(Dim_validate, object, "Matrix")) : 
  object 'Dim_validate' not found

在google上搜索各種問題，沒有找到相關(guān)解決方案，然后再集群的另外一個R中，缺正常讀取mtx文件，這樣看了，可能是版本兼容性的問題，查看另外一個Matrix包的版本：

#可用Matrix版本
packageVersion('Matrix')
#[1] ‘1.5.3’
#不可用Matrix版本：
packageVersion('Matrix')
#[1] ‘1.6.0’

解決問題

發(fā)現(xiàn)兩者版本不一樣，嘗試按照老版本的Matrix包，測試：

devtools::install_version("Matrix", version ='1.5.3') 
a=Matrix::readMM('matrix.mtx')
a[1:3,1:5]
#3 x 5 sparse Matrix of class "dgTMatrix"
#              
#[1,] . . . . .
#[2,] . . . . .
#[3,] . . . . .

終于解決問題，正常讀取mtx文件，通過此報錯，說明R包不一定最新的就合適，新的R包可能與其他的一些包存在一些兼容性問題。