發(fā)簡信
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ggClusterNet做網(wǎng)絡(luò)venn圖
參考資料https://mp.weixin.qq.com/s/VGkzzgLS2sU-a5zYPxlcWg[https://mp.weixin....
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使用eggnog-mapper進(jìn)行功能注釋
官網(wǎng)：https://github.com/eggnogdb/eggnog-mapper[https://github.com/eggnogdb...
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corrplot包與ggcorrplot相關(guān)圖
簡介：相關(guān)圖是基于相關(guān)系數(shù)矩陣?yán)L制的圖。通常是將1個變量映射到多個視覺元素，所以看起來很花哨。如果是橢圓： 則橢圓的色相對應(yīng)相關(guān)性的正負(fù)， 顏色...
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路徑分析圖
1. 數(shù)據(jù)格式 將環(huán)境數(shù)據(jù)和生物數(shù)據(jù)按下圖形式放入一個表格中，首列為樣品名，首行為環(huán)境理化因子或者相關(guān)生物參數(shù)名稱。數(shù)據(jù)選擇適當(dāng)?shù)臉?biāo)準(zhǔn)化，例如，...
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R包vegan的Mantel testsR包vegan的Mantel tests Mantel tests是確定兩組距離測度矩陣（而非兩組變量矩陣）之間相關(guān)性的相關(guān)性測試方法，用于判斷...
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12個ggplot2擴(kuò)展包幫你實(shí)現(xiàn)更強(qiáng)大的可視化
ggplot2 Extension “[http://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzI5MTcwNjA4NQ==&mid...
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相關(guān)性熱圖關(guān)于相關(guān)性，表示數(shù)據(jù)之間的相互依賴關(guān)系。但需要注意，數(shù)據(jù)具有相關(guān)性不一定意味著具有因果關(guān)系。 相關(guān)性在組學(xué)數(shù)據(jù)挖掘中應(yīng)用非常廣，如樣本的重復(fù)檢驗(yàn)...
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RNASeq
參考：https://tiramisutes.github.io/2018/12/04/ref-RNA-seq.html[https://tir...
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擴(kuò)增子分析——usearch+vsearch+qiime1
參考文章：1.http://m.itdecent.cn/p/c72bb359f050[http://m.itdecent.cn/p/...