發(fā)簡(jiǎn)信
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使用mysql命令從UCSC數(shù)據(jù)庫獲取refseq gene id to gene name
mysql --user=genome -N --host=genome-mysql.cse.ucsc.edu -A -D hg38 -e "s...
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PBS作業(yè)管理系統(tǒng)中如何批量刪除用戶的所有作業(yè)
如果批量提交任務(wù)后，發(fā)現(xiàn)有錯(cuò)誤，想要撤回，一個(gè)一個(gè)撤回太麻煩，如何批量地殺掉指定用戶所有的作業(yè)呢？只需如下一條命令就可以：qselect -u ...
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Linux系統(tǒng)下文件名出現(xiàn)中文亂碼如何重命名回來
一不小心在給文件重命名的時(shí)候輸入了中文字符，結(jié)果導(dǎo)致文件名亂碼，無法通過cat, less, rm 或者mv 之類的命令操作了。 如何重新命名它...
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網(wǎng)絡(luò)不好，如何通過本地安裝R包
在集群服務(wù)器上使用R語言，經(jīng)常會(huì)碰到很抓狂的事情，那就是服務(wù)器沒連因特網(wǎng)，而我們要安裝一些第三方的R包。以前寫過一篇R包的常用安裝方法(http...
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如何提取一個(gè)基因組中所有intron
最近有個(gè)任務(wù)需要從基因組中提取所有的內(nèi)含子（intron）區(qū)域。一開始覺得很簡(jiǎn)單，用ensembl上的biomart或者ucsc genome ...
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Linux上基于R安裝Peer包
閑言一下：一般不太喜歡寫這種類型的帖子的（大部分安裝步驟網(wǎng)上重復(fù)的帖子都很多），之所以要寫下這個(gè)包的安裝，是因?yàn)檫@個(gè)包比較小眾，帖子不多，再者我...
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什么是可遺傳性(度)?
今天讀文章碰到一個(gè)生僻的概念（只是對(duì)于我這個(gè)遺傳學(xué)學(xué)渣來說的），叫 ”narrow-sense heritability". 讀到這個(gè)的時(shí)候，腦...
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生物學(xué)研究中常見的統(tǒng)計(jì)檢驗(yàn)方法(二：Wilcoxon test)
上一篇我簡(jiǎn)單整理了t-test的用法和注意事項(xiàng) （我們主要講兩個(gè)獨(dú)立隨機(jī)樣本的t-test）。我們?cè)倩仡櫼幌?，t-test是參數(shù)統(tǒng)計(jì)檢驗(yàn)方法，其...
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R語言給散點(diǎn)圖添加Polynomial regression 擬合曲線和公式這篇文章本來是要寫進(jìn)我上一篇關(guān)于Polynomial regression實(shí)現(xiàn)的文章里的，但一方面由于這個(gè)給散點(diǎn)圖里添加擬合曲線和公式偏向畫圖，...