您好,大哥,我想跟您請教一個問題,我用orthofinder去鑒定16個物種(輪藻,一直到蘋果)的單拷貝基因,但是發(fā)現(xiàn)文件夾里沒有,如果是運行4個基因組,就有單拷貝。是不是基因組越多,單拷貝越少啊,這里,是像您說的,需要參數(shù)過濾嗎?如何過濾呢,我沒找到你的py腳本
Orthofinder2鑒定單拷貝基因并構(gòu)建進化樹實驗?zāi)康模罕容^基因組學,從基因組獲取單拷貝基因,并構(gòu)建有根的進化樹,并估計分化時間,最終畫出有分化時間的進化樹實驗流程:orthofinder2獲取單拷貝基因——muscle...