1.背景知識(shí) 在一篇文章里看到了微衛(wèi)星不穩(wěn)定性(Microsatellite Instability,MSI)與riskscore的關(guān)系圖,就去查了一下,很好的背景知識(shí)資料:...
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Aglient的芯片在科研界也是一大寵兒,通常根據(jù)其染色分為單通道和多通道兩種。最為奇葩的是Aglient芯片的許多表達(dá)矩陣下載后發(fā)現(xiàn)有空值、負(fù)值,因此就要求我們從原始數(shù)據(jù)開(kāi)...
代碼主要來(lái)自:https://satijalab.org/seurat/articles/integration_introduction.html[https://sati...
0.背景知識(shí) 參考地址:https://bioconductor.org/help/course-materials/2005/BioC2005/labs/lab01/bet...
DESeq2真狠,TCGA-PRAD數(shù)據(jù)差異分析用了半個(gè)小時(shí),而且還是多線程。這速度也沒(méi)啥提升呀 聲明:本文僅供學(xué)習(xí)交流用,禁止用于商業(yè)用途,如有侵權(quán),請(qǐng)聯(lián)系刪除。參考鏈接:...
前言 正則在實(shí)際中太多時(shí)候用到了,但還沒(méi)有系統(tǒng)梳理過(guò),這周學(xué)了一些正則參考實(shí)際經(jīng)常用到的寫(xiě)一個(gè)簡(jiǎn)單的手冊(cè)。 基礎(chǔ) 字符組 正則解釋[aA]字符組[] 允許匹配一組可能出現(xiàn)的字...
今天抽個(gè)空把單細(xì)胞領(lǐng)域的GO KEGG GSEA GSVA都做了一遍,跑完以后的感覺(jué)就是有這樣的理解,就是單細(xì)胞我首先會(huì)選擇做GSVA,但是我還會(huì)順便做下kegg或者GSEA...