1.背景知識(shí) 在一篇文章里看到了微衛(wèi)星不穩(wěn)定性（Microsatellite Instability，MSI）與riskscore的關(guān)系圖，就去查了一下，很好的背景知識(shí)資料：...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：江西
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TCGA的微衛(wèi)星不穩(wěn)定性數(shù)據(jù)獲取和可視化 -
R| Agilent芯片分析-limmaAglient的芯片在科研界也是一大寵兒，通常根據(jù)其染色分為單通道和多通道兩種。最為奇葩的是Aglient芯片的許多表達(dá)矩陣下載后發(fā)現(xiàn)有空值、負(fù)值，因此就要求我們從原始數(shù)據(jù)開(kāi)...
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單細(xì)胞多樣本整合分析代碼主要來(lái)自：https://satijalab.org/seurat/articles/integration_introduction.html[https://sati...
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gpr格式的芯片原始數(shù)據(jù)處理0.背景知識(shí) 參考地址：https://bioconductor.org/help/course-materials/2005/BioC2005/labs/lab01/bet...
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TCGA差異分析|2.DESeq2DESeq2真狠，TCGA-PRAD數(shù)據(jù)差異分析用了半個(gè)小時(shí)，而且還是多線程。這速度也沒(méi)啥提升呀 聲明：本文僅供學(xué)習(xí)交流用，禁止用于商業(yè)用途，如有侵權(quán)，請(qǐng)聯(lián)系刪除。參考鏈接：...
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正則表達(dá)式手冊(cè)前言 正則在實(shí)際中太多時(shí)候用到了，但還沒(méi)有系統(tǒng)梳理過(guò)，這周學(xué)了一些正則參考實(shí)際經(jīng)常用到的寫(xiě)一個(gè)簡(jiǎn)單的手冊(cè)。 基礎(chǔ) 字符組 正則解釋[aA]字符組[] 允許匹配一組可能出現(xiàn)的字...
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單細(xì)胞的GO KEGG GSEA GSVA分析今天抽個(gè)空把單細(xì)胞領(lǐng)域的GO KEGG GSEA GSVA都做了一遍，跑完以后的感覺(jué)就是有這樣的理解，就是單細(xì)胞我首先會(huì)選擇做GSVA，但是我還會(huì)順便做下kegg或者GSEA...
