作者，Evil Genius~~ 空間轉錄組的運用方向：轉錄、蛋白 ST最適合回答三種生物問題：首先可以闡明組織的細胞類型組成；第二類問題與細胞相互作用有關；最后可以幫助闡明...
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空間轉錄組的幾個分析要點及經(jīng)典文獻分享 -
MISTy：空間轉錄組細胞互作分析方法1. 簡介 MISTy主要有四個功能： 算法：Multi-view framework to dissect effects related to CCI (剖析與細胞-細胞...
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ggplot2繪制單細胞經(jīng)典火山圖單細胞繪圖系列： Seurat繪圖函數(shù)總結[http://m.itdecent.cn/p/95e61f7e834d] 使用ggplot2優(yōu)化Seurat繪圖[https...
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文獻學習069--[sc+st]單細胞和空間轉錄組分析揭示結直腸癌中FAP+成纖維細胞和SPP1+巨噬細胞的相互作用作者通過整合分析scRNA-seq數(shù)據(jù)、公開發(fā)表的scRNA-seq和bulk RNA-seq數(shù)據(jù)集、空間轉錄組數(shù)據(jù)、FACS、IF和免疫治療的轉錄組數(shù)據(jù)，證實FAP+成纖維...
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空間轉錄組合作項目分析示例(二)作者，Evil Genius 這一篇我們繼續(xù)合作項目的分析示例，我們在了解了空間轉錄組的整體分析內(nèi)容之后，就需要開始針對我們自己的數(shù)據(jù)進行有效分析，注意是有效分析，就是大家分...
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空間轉錄組去卷積分析工具介紹——CARD簡介 ??目前，單細胞技術發(fā)展迅速，單細胞轉錄組測序可以幫助我們獲得組織中每個細胞的基因表達水平，但卻無法獲得對應空間位置上的信息?？臻g轉錄組技術（spatial trans...
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CARD 空間轉錄組和單細胞轉錄組之間的反卷積首先附上參考文獻：《Spatially informed cell-type deconvolution for spatial transcriptomics》[https...
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最新12+單細胞生信，探索DAB2+ Macro與FAP+ CAFs關系，高端生信值得模仿！影響因子：12.4 研究概述：肝癌是全球第三大致癌死亡的原因，也是第六大常見的腫瘤類型。其中，肝細胞癌（HCC）為最常見的肝癌類型，其次為肝內(nèi)膽管癌（ICC），這兩種類型合計...
