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IP屬地：江蘇
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結(jié)合Seurat批量去除環(huán)境RNA污染（SoupX）2022-05-19 -
單細(xì)胞之軌跡分析-2：monocle2 原理解讀+實操軌跡分析系列： 單細(xì)胞之軌跡分析-1：RNA velocity[http://m.itdecent.cn/p/ee0f7a8e6a06] 擬時間序列分析（Pseudot...
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如何給Seurat對象的基因重命名？【基因名轉(zhuǎn)換】2022-07-27
適用背景 在單細(xì)胞分析中，必要的一步是對每個細(xì)胞進(jìn)行注釋，這相當(dāng)于給每個細(xì)胞打個標(biāo)簽，或者說起個別名，這些信息都存在@meta.data信息里，所以不用特意去更改細(xì)胞名字，S...
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無痛從seurat遷移到monocle3（UMAP seurat cluster）
注意，這里使用的seurat對象要求已經(jīng)run過runUMAMP()findCluster等函數(shù)，否則也沒有必要把seurat的結(jié)果弄到monocle3的cds對象里 1. ...
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sort配合awk對 GTF文件進(jìn)行重新排序
Hello，我是倚劍聽雨，每日隨手更新~帶你看生信小白的日常！ 如果你也打算在 hg19的 GTF 文件里添加 tRNA和 rRNA 的數(shù)據(jù)。 首先，tRNA 數(shù)據(jù)可以在GE...
