STAR+RSEM+Deseq2視頻課程鏈接已經(jīng)公開, https://www.bilibili.com/video/BV1KJ411p7WN?p=8[https://www...
發(fā)簡信
IP屬地：上海
-
轉(zhuǎn)錄組分析——STAR+RSEM+Deseq2 -
Bismark Bisulfite Mapper學(xué)習(xí)筆記（二）甲基化信息提取以及文件解讀(IV)Bismark甲基化提取 Bismark附帶一個(gè)補(bǔ)充的bismark_methylation_extractor腳本，它對(duì)Bismark結(jié)果文件進(jìn)行操作，并對(duì)每個(gè)C進(jìn)...
-
RNA-seq(5):序列比對(duì)：Hisat2比對(duì)軟件很多，首先大家去收集一下，因?yàn)槲覀兪菐Т蠹胰腴T，請(qǐng)統(tǒng)一用hisat2(官網(wǎng)https://ccb.jhu.edu/software/hisat2/index.shtm...
-
Gephi 官方手冊(cè)：一款關(guān)系可視化網(wǎng)絡(luò)圖工具的簡明教程Gephi 和網(wǎng)絡(luò)圖 今天要分享的一款網(wǎng)絡(luò)圖工具：Gephi。 你可能沒聽過 Gephi，但說起百度的 Echarts和阿里的 Antv Data，一定不陌生。 在這兩款的數(shù)...
-
CUT&Tag 數(shù)據(jù)處理和分析教程（5）引言 本系列[https://yezhengstat.github.io/CUTTag_tutorial/] 將開展全新的CUT&Tag 數(shù)據(jù)處理和分析專欄。想要獲取更多教程...
-
最全bcftools使用說明--只看本文就夠了1 簡介 BCFtools 是一款多種實(shí)用工具的集合，它可以用于處理VCF文件和二進(jìn)制的BCF文件。它可以接受VCF格式、壓縮的VCF格式以及BCF格式，并能自動(dòng)檢測輸入的格...
-
熱圖如何展示特定行名，縮放單元格大??？今天結(jié)合nature medicine中的一篇文章，和大家分享下熱圖的繪制，主要亮點(diǎn)功能是：（1）名稱太多看不清，如何只展示特定的名稱？（2）數(shù)據(jù)太密集，如何快速調(diào)整單元格的...
-
結(jié)合Seurat批量去除環(huán)境RNA污染（SoupX）2022-05-19相似關(guān)鍵詞 背景RNA，環(huán)境RNA，RNA污染，游離RNAbackground mRNAs, ambient RNA, RNA contamination, cell fr...
-
DoHeatmap的優(yōu)化+ComplexHeatmap繪制帶特定基因的單細(xì)胞熱圖單細(xì)胞繪圖系列： Seurat繪圖函數(shù)總結(jié)[http://m.itdecent.cn/p/95e61f7e834d] 使用ggplot2優(yōu)化Seurat繪圖[https...
