根據(jù)之前別人po文中的代碼進(jìn)行，發(fā)現(xiàn)行不通 出現(xiàn)了下面這樣子的報(bào)錯(cuò)： 看了下bioconduct上管理員還是誰回復(fù)的說是近期biomaRt上有很多下載大量數(shù)據(jù)的人，導(dǎo)致速度變...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：上海
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biomaRt基因同源轉(zhuǎn)換時(shí) 使用中遇到Timeout was reached的解決辦法
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解決RStudio Server: R is taking longer to start than usual
主要原因：當(dāng)使用RStudio Server處理占內(nèi)存極大的數(shù)據(jù)后，長時(shí)間不清理內(nèi)存，不關(guān)閉rstudio，可能會(huì)產(chǎn)生此種問題，建議計(jì)算完畢后，盡快清理內(nèi)存。 當(dāng)再次打開rs...
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讀《Computational-method-for-single-cell-data-analysis》跟著運(yùn)來兄搭建自己的生物信息小書房。趁年輕，讀幾本硬書，到老了慢慢反芻。 如果讓我推薦一本比較全面的單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析教材，我想會(huì)是《Computational-method-f...
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單細(xì)胞數(shù)據(jù)科學(xué)四大過程組兩大知識(shí)領(lǐng)域與三重境界很多朋友問是如何保持閱讀量的，其實(shí)，大部分是之前的存貨。有一部分是每有會(huì)意，把之前的舊書拿出來再翻一翻，做個(gè)導(dǎo)圖放上來的。今天，我想和大家分享一點(diǎn)最近對(duì)單細(xì)胞數(shù)據(jù)科學(xué)的理解，...
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使用MAESTRO整合分析scRNA和scATAC
Wang, C., Sun, D., Huang, X. et al. Integrative analyses of single-cell transcriptome a...
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上傳數(shù)據(jù)到GEO數(shù)據(jù)庫獲得GEO號(hào)20210106 14:24 參考的教程：Submitting high-throughput sequence data to GEO[https://www.ncbi.n...
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使用lftp上傳數(shù)據(jù)到GEO，賊快！推薦我之前在2021年寫過上傳數(shù)據(jù)到GEO數(shù)據(jù)庫獲得GEO號(hào)[http://m.itdecent.cn/p/003ef56dd311]，那時(shí)候使用ncftpput上傳數(shù)據(jù)，...
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SCI文章寫作以及文章修稿的一點(diǎn)體會(huì)情感: 離上次寫筆記快半年之久了，這半年來基本都把心思花在了一個(gè)課題上。這兩日終于把文章修回去了，靜下來心來整理這個(gè)課題的結(jié)果，想著總結(jié)自己這半年來文章寫作以及文章修稿的一些...
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clustree ： 聚類可視化利器我們知道在研究問題時(shí)，分組是很重要的，有分組才有故事可講。比如，兩塊田一塊施肥一塊不施肥，可以做比較嘛。在單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析中用到較多的數(shù)據(jù)分組技術(shù)是聚類（clustering）...
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愛生活愛學(xué)習(xí)愛運(yùn)動(dòng)的超級(jí)無敵鄭一一同學(xué)。偶爾郁悶，偶爾低沉，但大多數(shù)都是積極向上。慢慢學(xué)會(huì)認(rèn)識(shí)自己的不足，坦然接受自己的平凡，努力去做好手頭上的工作，并慢慢去探尋自己喜歡并且熱愛的東西。如果我的一輩子注定平凡，那么希望自己享受著平凡而美好的生活