SNPs marker是全基因組范圍應(yīng)用廣泛的分子標記，本文介紹生態(tài)基因組學(xué)中利用GATK4軟件進行SNPs calling的流程（人的研究中可能略有不同）。以下所有分析過程...
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SNPs calling流程（GATK4）
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除了GO基因本體論，還有PO、TO、CO等各種Ontology？我們最常用最熟悉的功能數(shù)據(jù)庫之一：GO（gene onotology），基因本體論。其實是一套標準詞匯術(shù)語，目的是從不同角度來描述某個基因的特點和功能，三大本體如生物學(xué)進程（...
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eQTL就那樣～（1）前言 我還未想到這個專題叫什么...... 暫定“XXX就那樣”？ 我們先來個斗雞眼，看著一下中間的QT。 1.什么是數(shù)量性狀？（quantitative trait，QT）...
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個人網(wǎng)站建設(shè)日記第1篇2022-08-03
今天我的個人網(wǎng)站提交的備案已經(jīng)通過服務(wù)商提交管局審核了，靜待7-20個工作日內(nèi)早點通過審核獲得備案號。 接觸網(wǎng)絡(luò)已有21年了，21年前的一個晚上，和師范同學(xué)帶著獵奇的心理跑到...
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GWAS分析-說人話（20）-單倍體關(guān)聯(lián)分析前言 來到這里，已經(jīng)漸漸不是人話了... 估計這輩子我也沒有想到，我把我最厭惡的東西寫出來， 居然是最多人看的...... 分析方法很多，這一小節(jié)吐槽官網(wǎng)的這一行代碼，大神請...
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R使用筆記：相關(guān)系數(shù):cor.test();corr.test();rcorr()本次筆記內(nèi)容：cor.test()和cor()rcorr() {Hmisc}corr.test() {psych}spearmanCI() {spearmanCI} spea...
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R語言-多線程并行化任務(wù)計算(分發(fā)計算任務(wù)到多個cpu內(nèi)核)R語言運行在CPU單核單線程上，提高計算效率可以通過并行包： 實現(xiàn),該包屬于base包，不需要額外安裝。 函數(shù)是 lapply 的并發(fā)版本，可以自定義進程數(shù)發(fā)揮多CPU核心的...
