隨著技術(shù)的發(fā)展，動(dòng)植物的全基因組測(cè)序到現(xiàn)在已經(jīng)超過了2000個(gè)，而且這個(gè)驚人的數(shù)字是在最近三年內(nèi)得到爆發(fā)的。這樣體量的數(shù)據(jù)涌現(xiàn)，為分子生物學(xué)的發(fā)展提供了巨大的助力。最近三天身...
IP屬地：甘肅
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2021-09-21基因的“命運(yùn)” -
備忘！<br>備忘！<br>備忘！
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分析 | GO 富集分析
從研一來到組里，一直聽到 GO 富集分析幾個(gè)字。直到現(xiàn)在，研二基本結(jié)束了，我都沒做過，也不會(huì)做。有一個(gè)大概的認(rèn)識(shí)，就是，自己的基因集中某種功能基因的占比要高于這種功能的基因在...
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學(xué)習(xí)筆記<br>研究方向: 植物群體遺傳學(xué)<br>
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周運(yùn)來，男，長(zhǎng)大了才會(huì)遇到的帥哥，穩(wěn)健，瀟灑，大方，靠譜。一段生信緣，一棵技能樹。生信技能樹核心成員，單細(xì)胞天地供稿人，簡(jiǎn)書創(chuàng)作者，單細(xì)胞數(shù)據(jù)科學(xué)家。
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RDA分析原理1. RDA的基本方法描述 冗余分析（RDA）和基于轉(zhuǎn)化的冗余分析（tb-RDA） Rao（1964）首次提出冗余分析（Redundancy analysis，RDA），從概...
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2021-10-23基因組學(xué)與植物育種實(shí)際上，最近幾年我已經(jīng)參與了若干物種的基因組學(xué)項(xiàng)目。我一直在思考：除了提供一批數(shù)據(jù)之外，我們的研究還能對(duì)實(shí)際生產(chǎn)產(chǎn)生怎樣的推動(dòng)作用？基因組組裝和基因注釋在整個(gè)育種研究中處于什...
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2021-11-12R包安裝報(bào)錯(cuò)怎么解決實(shí)話說，這是一個(gè)非常龐大的問題，因?yàn)檫@個(gè)牽扯到服務(wù)器硬件，系統(tǒng)等軟件因素，還有一些網(wǎng)絡(luò)問題導(dǎo)致的玄學(xué)問題，復(fù)雜性導(dǎo)致它很有挑戰(zhàn)。但是，我們不能因?yàn)橛刑魬?zhàn)性就放棄了，畢竟總會(huì)不...
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2021-09-21基因的“命運(yùn)”
隨著技術(shù)的發(fā)展，動(dòng)植物的全基因組測(cè)序到現(xiàn)在已經(jīng)超過了2000個(gè)，而且這個(gè)驚人的數(shù)字是在最近三年內(nèi)得到爆發(fā)的。這樣體量的數(shù)據(jù)涌現(xiàn)，為分子生物學(xué)的發(fā)展提供了巨大的助力。最近三天身...
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2021-10-18不重裝升級(jí)windows下的R
1.更新R 打開現(xiàn)有版本的R， 這時(shí)會(huì)提醒很多，要不要安裝最新版，安裝路徑，裝完了要不要把舊的R包拷貝過來等等，一路yes此時(shí)就安裝成功了，關(guān)閉兩個(gè)版本的R 2.Rstudi...
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2021-01-05ComplexHeatmap熱圖R包參數(shù)解讀
之前畫熱圖一直在用pheatmap,簡(jiǎn)單美觀，但是后面有了些特殊需求之后,人就不知足了，所以轉(zhuǎn)到了功能更全面但是相對(duì)更難入手的 ComplexHeatmap[http://w...
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2020-11-22R腳本模板
此模板以shell語言下經(jīng)常用到的長(zhǎng)數(shù)據(jù)變寬數(shù)據(jù)為例輸入數(shù)據(jù) aaa，第一列必須為計(jì)數(shù)，二三列不特殊要求，不含列命 run: 得到兩個(gè)文件,以bbb為前綴
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2021-03-21R語言中的管道符 %>%
作為R語言基礎(chǔ)之一的 %>% 應(yīng)用非常廣泛，但是我卻一直沒有系統(tǒng)地學(xué)習(xí)，實(shí)在不應(yīng)該，今天研究記述一下。 什么是%>% %>% 作為一種管道符，意思是 %>% 把左邊的輸出傳遞...
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2021-03-02上古軟件silix的安裝因?yàn)轫?xiàng)目需要，安裝一個(gè)非常古老的軟件 silix，想要安裝的版本1.2.9已經(jīng)是14年的產(chǎn)物了。網(wǎng)址：http://lbbe.univ-lyon1.fr/-SiLiX-?la...
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精彩的文章都是一樣的，平庸的文章各有各的平庸
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文獻(xiàn)解讀（一）：植物基因組文獻(xiàn)前言 小編要分享的這篇文章是2020年10月19發(fā)表在Nature Communications雜志上，很榮幸征得作者本人（北京林業(yè)大學(xué)林木分子設(shè)計(jì)高精尖創(chuàng)新中心博士生 ...
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